分子对接的数据库准备和配体、受体的预,挺像前端开发里拉接口、清数据、调结构的那一套。ZINC、PubChem 这些数据库就像是组件库,直接拉来就能用。配体准备也蛮有意思的,2D 转 3D、加氢加电荷、调 pH 值,就像一张图,要加滤镜、调光、裁剪,变得适合对接这个“前端页面”了。受体准备更讲究,要去水、找口袋、调电荷,像是写布局前先要把容器好。这些环节看似小事,其实决定了后面对接的成败,别小看哦!
分子对接数据库与配体受体准备
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Eclipse 连接 SQL Server 2008 数据库步骤:
驱动准备: 下载 SQL Server JDBC 驱动程序并将其添加到 Eclipse 项目中。
项目配置: 在 Eclipse 项目中创建一个新的数据源连接。
连接信息填写: 在数据源配置中,选择 SQL Server 驱动程序,并提供数据库连接信息,包括主机名、端口号、数据库名称、用户名和密码。
测试连接: 保存配置信息后,测试连接以确保配置正确。
开始使用: 连接成功后,即可在 Eclipse 中使用 Java 代码操作 SQL Server 2008 数据库。
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步骤一:准备工作
确保已经安装 Eclipse IDE 和 SQL Server 2008。
下载并安装 Microsoft JDBC Driver for SQL Server。
步骤二:配置 Eclipse
打开 Eclipse IDE,点击“窗口”>“显示视图”>“其他”。
在弹出的窗口中选择“数据源资源管理器”,点击“确定”。
在“数据源资源管理器”视图中,右键点击空白处,选择“新建”>“其他”。
选择“连接配置文件”>“数据库连接”,点击“下一步”。
选择“Microsoft SQL Server”,点击“下一步
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这种方式适合刚入门的同学,是你还不太熟Python或者Pandas的话,用 Weka 图形界面更省事。而且小文件效果还不错,响应也快。
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