酶切位点筛选的脚本,挺适合搞 SNP 标记开发的你。它的核心就是把SNP 位点转成CAPS 标记,也就是让原来只能用 HRM 搞的东西,变得更通用一点。你只要准备好已知的 SNP 位点,它就能帮你筛选出合适的酶切位点,起来还蛮快的,省了不少手工比对的麻烦。

比起传统的 HRM 方法,这种CAPS 转换方案更稳定,也方便后续扩展。尤其适合在没有太多高通量设备的实验室环境里搞事情。代码逻辑清晰,脚本结构也不复杂,就几个关键函数,改起来也方便。

如果你对标记管理感兴趣,可以顺手看看极客标记标记管理工具,工具界面简单,功能挺实用的。另外像GTASSIST这样的资源也不错,对遗传标记选择有不少经验总结。

哦对了,完之后别忘了校验一下酶切是否唯一,避免在 PCR 过程中出现多重扩增。,这套脚本挺适合初学者和搞分子标记的朋友,自己用或者分享都方便。