Matlab 的icoshift工具，是我最近用下来感觉挺顺手的光谱数据对齐小神器，适合那种 1D NMR 或者类似的谱图数据。

核心是它用FFT搞定区间相关移位，对一堆谱图统一快速对齐，效率比不少文献里提的方法都要快，不用下采样也能跑全分辨率，挺适合玩大数据量的。

对了，它还能用NaN填充缺失值，避免在段落边界出现那些让人头疼的伪影，这点在调光谱时蛮实用的。更方便的是，程序本身就带了演示文件，直接拿真实 NMR 数据试手，直观。

算法思路不复杂，界面清爽，你只要装好MATLAB 2014b或更新版本，直接开跑。还有完整的文档，基本看一遍就能上手。

如果你手上也有批量谱图数据要对齐，强烈建议你试试。想深入研究的话，可以看看它的原始论文（J. Magn. Reson. 2010）讲得蛮清楚的。

顺手附几个相关的 FFT 工具链接，对你也有：

如果你是做代谢组学或者常用 MATLAB 光谱数据，这工具真不妨一试。