CIAtah(发音为cheetah;以前是calciumImagingAnalysis [ciapkg])是用于对单光子和双光子成像数据集进行钙成像分析的软件包。最新代码可在GitHub上找到:https://github.com/bahanonu/calciumImagingAnalysis。请参阅GitHub或https://git.io/ciapkg_docs获取详细自述文件和信息。软件包包括GUI,允许用户执行大规模批处理分析,可通过存储库中的“calciumImagingAnalysis”类访问。还提供命令行就绪的分析管道。主要功能包括预处理、细胞提取、细胞分类等。此外,还包括用于动物位置确定的代码。
CIAtah软件包钙成像数据集分析的新工具
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