这个存储库提供与我们提交的内容相关的Matlab的无花果生成代码TargetScan辅助工具。该工具可以在多种生物中鉴定带注释基因的假定miRNA结合位点,并可视化miRNA介导的阻抑效应。此外,它还利用UTR的全基因组多序列比对,进行短基序进化性质的统计分析,优化和计算上下文特征,以支持机器学习算法的训练。如果需要在测试集上比较各种预测算法的性能,这个工具也能提供帮助。
Matlab无花果生成代码TargetScan工具的进化和功能分析
相关推荐
MATLAB功能分析傅里叶角谱分析代码用于生成和统计皮质特征图
这组MATLAB函数专为生成和分析皮质特征图而设计,涵盖了皮质特征图的各个方面。所有功能均在MATLAB R2014b下开发和测试。这些代码支持Cloherty等人(2016年)论文中描述的分析。tests.m文件包含了函数的测试和示例集合,用于预处理、生成扩展空间去相关、图像对齐等。orientation_hist函数从OP地图生成方向偏好的直方图,crossing_angle_dist计算OP和OD地图轮廓之间的交叉角分布,od_op_crossing分析OP轮廓与OD地图的交叉点。
Matlab
8
2024-08-11
MATLAB的核心特点与功能分析
MATLAB的开发环境具备高效的编程、数值处理和图形化功能,能够快速绘制图形并进行高级数据可视化。此外,MATLAB提供图形用户界面(GUI)设计工具,方便用户构建交互式应用程序。同时,MATLAB支持文件I/O操作和外部应用程序接口(API),使得数据交换更加便利。
Matlab
13
2024-11-05
系统功能分析
系统功能分析流程
非数值计算问题:已知游泳池长宽,求面积。数学模型:area = len * wide解决方法:1. 输入长宽2. 计算面积3. 输出面积
数据结构:数组、链表、栈、队列、树、图数学模型:抽象数据结构算法:实现数据结构的具体操作分析与设计:算法效率、可扩展性编程:将算法转化为代码
SQLite
12
2024-04-30
dbSNP数据库的结构与功能分析
dbSNP数据库作为一个重要的遗传变异数据库,在基因组学研究中具有关键作用。它记录了广泛的单核苷酸多态性数据,帮助研究人员理解遗传变异对个体特征和健康的影响。dbSNP数据库的结构包括多种数据类型和交互功能,为科学研究提供了丰富的资源。
SQLServer
9
2024-07-23
Oracle数据库中AWR、ADDM和ASH脚本功能分析
在$ORACLE_HOME/rdbms/admin目录下,AWR、ADDM和ASH脚本提供了详细的数据库性能分析和故障诊断功能。这些脚本通过收集和分析关键的性能指标数据,帮助数据库管理员优化数据库运行效率,提升系统稳定性和响应速度。AWR提供历史性能数据的报告和分析,ADDM根据AWR数据自动诊断数据库性能问题并提供建议,而ASH则记录数据库活动的详细信息,用于实时性能监控和故障排除。通过这些工具,Oracle数据库管理者能够更好地管理和优化数据库性能。
Oracle
12
2024-08-25
使用Matlab生成正弦函数代码功能共享与差异分析
这个存储库包含差异分析项目中共享的文件,避免重复。文件已根据需求进行了改编,需将此文件夹及其子文件夹添加到Matlab路径中。此文件夹包括用于Beattie等人使用的Hodgkin-Huxley模型和Wang模型的Mex代码,以及用于计算参数敏感度的额外Mex文件。如果修改Mex文件,需要使用以下命令重新编译:mex -I/path_to_CVODE/include -L/path_to_CVODE/l
Matlab
10
2024-09-18
clusterProfiler R包实现基因和基因簇功能分析与可视化
clusterProfiler 该软件包实现了分析和可视化基因组坐标(由支持),基因和基因簇的功能概况的方法。有关详细信息,请访问。 :writing_hand: 作者余光创(南方医科大学基础医学院)使用 clusterProfiler 时,请引用以下文章:于庚,王L,韩Y和何Q。 clusterProfiler:一个R包,用于比较基因簇之间的生物学主题。OMICS:综合生物学杂志*。 2012,16(5):284-287。
统计分析
15
2024-11-06
数字图像匹配软件的设计与功能分析
通过分析题目要求,该软件主要分为两大模块:数字图像处理和数字图像匹配。在图像处理模块中,用户可以进行放大、缩小、翻转和灰度处理等操作。在图像匹配模块中,用户可以对两张图像进行匹配,并查看匹配结果。
Matlab
15
2024-09-27
Oracle+ODI+ESSBASE+BIEE离线客户端的全功能分析
离线分析具备所有功能的离线客户端业务模型,Disconnected BI Server服务缓存计算离线用户使用方式和在线用户相同。Dashboard和Answers功能在服务器连接时也同样有效。Oracle操作数据、离线数据、元数据和报表定义Web Catalog展现元数据。
Oracle
15
2024-08-10