Freesurfer 是一个功能强大的工具，提供大量功能来处理和分析MRI图像。它生成灰质和白质分割，使用用户定义的标签或其标签之一派生的小片段。附带的工具 tksurfer 能根据地图集标签上色，例如，对表面进行着色。PySurfing 是一个开源工具，扩展了tksurfer，提供一个接口，为Freesurfer地图集的区域着色，支持（全部）分割。受到Anderson Winkler博士的工作启发，PySurfing提供方便的解剖可视化工具，以呈现数学建模结果。PySurfing 需要安装以下软件：Freesurfer 版本7或更高版本，MATLAB 版本2020b，Python 3.8或更高版本。