生物质应用

生物芯片技术，特别是在生物领域的应用，是一种高度集成的科学技术，源自核酸分子杂交的基础。它包含高密度的生物信息分子，如寡核苷酸、基因片段、cDNA、蛋白质等，在固相支持介质上固定。生物芯片的核心特点是高通量、微型化和自动化，使得生命科学研究中的分析可以一次性完成。根据不同的载体材料和固定生物分子类型，生物芯片分为多种类型，如基因芯片和蛋白质芯片。生物芯片在医学、生物学、药物研发等领域广泛应用，推动了生命科学和医学的进步。

这个项目提供了用于模拟含有磁性粒子的软物质的MATLAB代码。使用Stoner-Wohlfarth模型对硬磁颗粒进行了模拟，而磁性软粒子遵循Froehlich-Kennelly定律。代码适用于Octave或Matlab软件，并在SwParticle类中实现了磁滞的模拟。

生物序列聚类研究在数据挖掘技术的指导下取得了重要进展。

《国际时序生物学》中MATLAB的gn算法代码，用于自适应陷波滤波器和昼夜相移估计的参数调整过程。包括五个Simulink文件：ANF_1st.mdl至ANF_5th.mdl，分别运行1阶至5阶的自适应陷波滤波器。MATLAB代码Adaptive_notch_filter.m实现1阶至5阶ANF的估计值和昼夜节律相位比较。此外，Evolutionary_Strategy_ANF_mutation.m文件通过进化策略优化ANF参数。

探讨了鸡群优化（CSO）这一新兴的仿生算法，由Xian-Bing (2014)提出，并采用matlab进行开发。CSO利用先天多群和自适应算法的特性，展现出在解决复杂问题时可能优于其他元启发式算法的潜力。

Python在包括Microsoft Windows、Mac OS X、Linux和UNIX在内的常用计算机操作系统上都可以使用。在Windows上，您通常需要下载和安装Python，因为它不是标准配置。在大多数新的Mac OS X、Linux和UNIX系统中，Python已经作为标准配置包含（实际上，一些Linux操作系统的部分是用Python编写的），尽管您应该检查您所拥有的Python版本：在命令行输入'python'可查看版本。您可以在本书末尾的参考部分或剑桥大学出版社网站：http://www.cambridge.org/pythonforbiology 查看Python在各种平台上

Ode是一种生物建模DSL，用于描述由ODE、SDE和SSA React组成的空间同质数学生物模型。它由模块化建模语言和使用LLVM编译器框架的高性能仿真后端组成。这项工作是在牛津大学计算机科学系的计算生物学研究小组内进行的，研究软件工程实践在数学生物建模领域的应用，最初的重点是心脏电生理模型。也可以从本网站下载由这项工作产生的随附的D.Phil论文。多篇支持这项工作的论文已发表。

WHO微生物分析系统提供数据统计、计算、图表功能，并支持数据导出至Excel。

生物信号和生物医学图像处理第五章代码

使用Matlab开发基于语音的生物特征识别系统，该系统识别文本相关的说话人。