JCuda 写的 DBSCAN,真的是硬核中的硬核。完全用 GPU 跑聚类,速度相当给力,尤其数据量一大,优势就体现出来了。只要你机器上装了 NVIDIA 显卡,搞定 CUDA 环境,剩下的就按步骤来就行,没啥坑。
JCuda 的 DBSCAN 实现比较适合那种对性能要求高的场景,比如地理空间数据、海量图像特征提取啥的。核心代码是个.cu
文件,直接用nvcc
编译成.ptx
,Java 调用它,顺滑。关键一步:记得把JCuda-All-0.8.0-bin-linux-x86_64.zip
解压好,里面的.so
和.jar
都不能漏。
编译时用javac -Djava.ext.dirs=...
这句,路径记得写对,多人就卡在这一步了。还有运行命令java -Djava.ext.dirs=... Test
,和编译路径一致就稳了。哦对了,内核代码你可以自己改,比如getNeighbors.cu
这个,是拿来算密度邻居的,可以根据需求调调参数。
如果你还在用纯 CPU 跑 DBSCAN,不妨试试这个。初期配置稍微繁琐点,但跑起来那叫一个爽。你也可以顺便看看这些相关文章,有的是 Java 实现的,有的是 Python、Matlab,比较一下各自风格和性能,挺有意思的:
- DBSCAN 聚类算法 Java 实现
- DBSCAN 算法示例解析
- DBSCAN 算法 Matlab 实现聚类算法
- Python 实现 DBSCAN 聚类算法
- Nvidia 驱动安装方法 Ubuntu 18.04.2RTX2080
- CUDA 并行编程架构术语解析
如果你已经配好 CUDA 环境,不妨直接跑一下试试;要是刚入门 CUDA,也可以当作一个练手项目,顺带把 Java 和 GPU 打通的流程走一遍,收益不小。