IMvigor210CoreBiologies 的安装包+数据,挺实用的一个资源。原文档下不动了,我就顺手整理了一份打包放这了,省得你再去翻。压缩包里头有两个东西,一个是IMvigor210CoreBiologies_1.0.0.tar,这是安装包;另一个是提取出来的.Rdata文件,里面包含了测序数据和临床信息,直接可以喂进你的流程,省事不少。

数据的场景下,像免疫疗效评估、PD-L1 表达研究啥的,拿这个数据练手或者跑实际项目都挺合适的。是用R配合Bioconductor生态,加载也简单,基本一行代码就能搞定,响应也快。

嗯,注意下,Rdata文件里的字段还挺多的,字段名记得先熟悉下再。不然一不小心就容易漏掉关键变量。比如临床表型中的censorTimeos字段,挺常用的。

如果你对RNA-seq数据感兴趣,可以顺便看看RNA 测序数据中的计算挑战,里面对算力瓶颈和优化方法讲得还不错,配合这个数据用效果更好。

安装包怎么用?直接运行:

install.packages("IMvigor210CoreBiologies_1.0.0.tar", repos = NULL, type = "source")
也可以拖进 RStudio 里一键安装,蛮方便的。

如果你正好在做免疫治疗方向的可重复,这个包+数据组就还挺对路的,能省下不少准备数据的时间。