多个 ChIP-seq 样本的质量检查、标准化、可视化一把抓，用的就是DROMPAplus。这工具是用 C++写的，性能方面不用担心，跑数据速度挺快，尤其适合批量的时候。

SAM、BAM、CRAM这些主流的 mapping 文件格式它都能接，bigWig、bedGraph之类的输出格式也没问题，兼容性还不错。输出的质量指标一目了然，不需要手动东查西找，挺省事。

比较贴心的一点是，它能直接输出PDF格式的可视化结果，分享给不太懂代码的合作伙伴也方便，像你要给生信实验室的小伙伴发数据图，就不怕对方打不开了。

片段长度估计这块它是自动搞定的，省了不少麻烦。而且两个样本的对比图也能在一张图里画出来，比如看H3K4me3和H3K27ac的共现，直观。

，如果你手上有一堆 ChIP-seq 数据需要清洗、比对、画图，一条龙，DROMPAplus还是挺靠谱的。配合其他归一化和可视化工具效果更好，比如你可以看看这几个：

如果你正愁着怎么快速整理 ChIP-seq 结果图，或者不想折腾太多脚本，那就试试它吧。