SmarTrace Matlab链追踪程序用于AFM单分子图像分析

ReadSTP 允许您从分子成像原子力显微镜 (AFM) 文件中提取选定的数据缓冲区，并将数据加载到 MATLAB 矩阵中，方便后续分析和处理。

原子力显微镜测量链霉亲和素-生物素复合物的断裂力。采用常规方法和模糊逻辑算法处理力曲线，以确定断裂力的分布。基于模糊逻辑的分析消除了热噪声伪影，从而得出更高的断裂力。研究表明，方法的选择会影响对配体-受体相互作用的理解。

LAND 软件包对单分子定位显微镜 (SMLM) 数据进行定量分析，尤其适用于处理大样本量和高发射体密度的数据。 功能 2D 和 3D SMLM 数据分析算法: 基于密度的噪声应用空间聚类 (DBSCAN) 基于 Voronoi 的聚类分析 里普利函数 径向分布函数 (RDF) 最近邻分析 (NN) 距离分析 用于量化核纳米结构构象和纹理的算法 (SMLM-ConText) 数据可视化 具有批处理功能的用户界面 软件获取与安装 下载软件包并解压缩 LAND-master.zip 文件。 将生成的 LAND-master 目录复制到本地 MATLAB 工作目录中。 在 MATLAB 命

该程序能够读取RAW格式的图像数据，用户只需输入文件名和图像尺寸即可快速获取所需图像。

卷积滤波器matlab代码bfield_piv用于粒子图像测速工具链。该代码利用MatPIV工具箱执行速度场的PIV计算。大部分Matlab代码在这里执行原始图像的预处理，利用ImageJ宏以改善流中粒子的可见性，并平衡图像对之间的强度级别。设置输入结构以运行MatPIV和过滤器，然后计算速度场后处理。从PIV速度场计算其他流量统计信息，并创建人物和电影只要有可能，bfield_Piv将并行运行以大大提高性能，并将充分利用所有CPU内核，并在超级计算机的无头模式下运行。用法示例-用户输入和设置-批处理在该示例中的实验对应于海洋流体动力学涡轮的湍流尾流的PIV。这是示例中的涡轮机图像；有趣的功能

matlab中值滤波代码用于分析单分子力谱数据中的停留时间。该软件的应用场景包括“RepC–PcrA复合物对DNA的切割和解链动力学”（Carolina Carrasco等人，2020）。这些代码适用于Linux系统，在终端中执行。跟踪文件需与扩展迹线代码位于同一路径下，文件格式为.txt，包含时间、扩展、易位开始时间和完成时间等信息。

在MATLAB中，边缘链码的实现主要用于提取图像中物体的边缘。通过遍历物体轮廓的每个像素点，记录其相对位置，可以得到该物体的边缘链码。展示了边缘链码的实现方法，但需要注意的是，当前的实现存在一些小漏洞，仅供参考。 实现步骤：1. 输入图像并进行预处理，提取物体轮廓。2. 遍历物体轮廓点，依次记录每个边缘点的方向，生成链码。3. 将链码进行格式化输出。 注意事项：- 输入图像应为二值化图像，且物体轮廓应清晰。- 本实现可能在某些复杂图形上存在不完全准确的链码生成问题。 尽管存在小漏洞，这种方法仍然适用于基础的边缘提取任务。

扩展了 SMALL-LABS，一个用于单分子精确定位的软件，增加了基于 pSMLM 的本地化。代码中包含对 pSMLM 异源 PSF 的描述。

MATLAB小动物图形代码——对象跟踪 objectTrack 是一个 MATLAB 例程集合，专门用于在视频中 追踪小对象，特别适用于追踪 大米蒿（Artemia Franciscana）。objectTrack 系统能够将小动物与背景区分，并通过多个预处理步骤和强度分割来实现对目标的清晰捕捉。 objectTrack 的主要特点包括： 背景扣除与分割： 使用多重预处理步骤，实现背景扣除，便于后续的对象分割。 应用双滞后阈值技术，快速高效，比神经网络或深度学习方法执行速度更快。 运动模型跟踪： 使用 Kong 运动模型实现对象的持续跟踪。 用户友好的交互设计： 用户只需在预