单分子研究

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模糊逻辑算法用于单分子力谱的分析
原子力显微镜测量链霉亲和素-生物素复合物的断裂力。采用常规方法和模糊逻辑算法处理力曲线,以确定断裂力的分布。基于模糊逻辑的分析消除了热噪声伪影,从而得出更高的断裂力。研究表明,方法的选择会影响对配体-受体相互作用的理解。
Matlab代码从TIF转换成原始CaMKII单分子数据
这篇Matlab代码自述文件提供了将.tif格式的原始图像转换为CaMKII单分子数据的详细步骤。使用ImageJ的虚拟堆栈生成合成图像,包括488和560通道。通过CAMKII_ImageJ_Preprocessing_Duplication_v2_TwoChannel_WOBlank.m代码重建重复图像,以便在TrackMate模块中进行粒子跟踪。输出包括Tirf488.tif(488通道)和Tirf560.tif(560通道),对应于488:560复合对的数据。使用TrackMate插件分析这些图像来检测单个粒子,生成.csv文件包含点和跟踪统计信息,并附带频道名称。
LAND: 用于单分子定位显微镜数据分析的软件包
LAND 软件包对单分子定位显微镜 (SMLM) 数据进行定量分析,尤其适用于处理大样本量和高发射体密度的数据。 功能 2D 和 3D SMLM 数据分析算法: 基于密度的噪声应用空间聚类 (DBSCAN) 基于 Voronoi 的聚类分析 里普利函数 径向分布函数 (RDF) 最近邻分析 (NN) 距离分析 用于量化核纳米结构构象和纹理的算法 (SMLM-ConText) 数据可视化 具有批处理功能的用户界面 软件获取与安装 下载软件包并解压缩 LAND-master.zip 文件。 将生成的 LAND-master 目录复制到本地 MATLAB 工作目录中。 在 MATLAB 命
分子筛研究动态可视化分析
基于信息可视化软件,分析了2000-2019年分子筛领域27519篇英文文献,绘制了知识图谱,揭示研究热点和新趋势。
SmarTrace Matlab链追踪程序用于AFM单分子图像分析
打击迹线的 SmarTrace 的 Matlab 代码挺适合做单分子,尤其是搞AFM 图像的朋友。界面借了EasyWorm GUI的思路,操作比较直观。只要你用过Matlab 2018a或更新版,直接把文件夹扔进路径里就能跑。 嗯,SmarTrace 专门用来追踪那种明亮的链状结构,像胶原蛋白或者 DNA 的纤丝图,背景偏暗的图也没问题。想试试?先装好深度学习工具箱,再把图像放到同一目录,省得路径出错。响应也快,代码也简单,算是入门和进阶都适合的一个工具。 如果你还想了解更多,推荐你看看它的论文,或者去找找类似的工具,像AFMunroll或者BayesPI,都挺有意思的。
胶体研究单粒子跟踪Matlab代码修复
Matlab代码中存在部分无法运行的问题。需要的C++库包括:列出名称、当前使用的版本、网站及简短说明。我倾向于半一致地更新已安装的库。用于存储粒子位置,如果位于非标准位置,请在CMakeLists.txt中设置HDF5_ROOT以指向正确路径。关于图像数据提取自*.tif文件,如果不在标准位置,请在iden/CMakeLists.txt中设置FREEIMAGE_ROOT。IPP可以完美配合用于图像处理,同样需在iden/CMakeLists.txt中设置IPP_ROOT如果非标准位置。对于解析xml参数文件,如果XERCESC_ROOT不在标准位置,请在CMakeLists.txt中设置。这
解析分子成像 AFM 文件
ReadSTP 允许您从分子成像原子力显微镜 (AFM) 文件中提取选定的数据缓冲区,并将数据加载到 MATLAB 矩阵中,方便后续分析和处理。
matlab中值滤波代码单分子力谱数据的停留时间分析
matlab中值滤波代码用于分析单分子力谱数据中的停留时间。该软件的应用场景包括“RepC–PcrA复合物对DNA的切割和解链动力学”(Carolina Carrasco等人,2020)。这些代码适用于Linux系统,在终端中执行。跟踪文件需与扩展迹线代码位于同一路径下,文件格式为.txt,包含时间、扩展、易位开始时间和完成时间等信息。
LTE 上行链路单载波 OFDMA 研究
探讨了基于 UMTS-OFDMA 和 SC-FDMA 的无线接入中 LTE 上行链路单载波 OFDMA 的技术特性和应用。
基于TRIZ冲突矩阵的单目标优化方法研究
TRIZ 的冲突矩阵用来搞定设计冲突,确实是个老牌好工具。是在做单目标优化的时候,像要提升效率但又不想牺牲成本,常规方法一上来就卡壳。但这个方法还挺的,它把那些工程里的冲突,借助聚类给分类整理了,省得你一个个参数去对照。整体流程也不复杂,、匹配、验证,一步步来,响应也快,思路还挺清晰的。 统计+聚类的组合,用在 TRIZ 矩阵上,蛮巧妙的。比如你要提升结构强度,那到底是从材料、工艺还是几何参数下手?这个方法会帮你找到跟你目标最相关的几个通用参数,推荐已有的改进策略。说白了,就是给你快速缩小搜索范围,少走弯路,挺省心。 实际用起来,有个点要注意:你得先把设计需求抽象成 TRIZ 里的通用工程参数