质谱数据的贝叶斯工具,用 Matlab 写的,蛮适合做生物样品的分类特征挖掘那一块。你给一堆带标签的光谱数据,它就能帮你搭个三级的贝叶斯网络,把那些跟“疾病”相关的质量点挑出来。挺适合搞蛋白质组学或者做生物标志物筛选的朋友试试。

从类变量开始做根节点,往下两级筛特征——一级是跟类别强相关的质量点,二级是跟一级强相关的,比如修饰位点、加合物什么的。结构思路清晰,逻辑也挺合理。输入是标准的光谱矩阵+标签+样本 ID,输出会给你特征出现频率,能估下结果稳定不稳定。

函数里还内置了n 折交叉验证,迭代多轮都可以。输入特征是连续值,但内部会自动离散化,不用你操心。就是得自己先做一下峰值提取和对齐,这块它没包含进来。结束后还能看到二级特征和它“父节点”的组合效果,有时候比单独看更准。

如果你在做蛋白质识别光谱分类或者想用贝叶斯方法挖潜在的诊断指标,蛮推荐你拿去玩玩看。代码用 Matlab 写的,跑起来还蛮快的,逻辑也容易跟。

另外,这几篇相关的资源也挺不错的:学习贝叶斯网络质谱基础LFQ-Analyst,建议配合着看,更快上手。

如果你自己也在整理生物组学数据,又刚好对特征选择有点要求,可以先用它筛一轮,再接后续的分类器,比如 SVM 啥的,组合用效果更稳。