该生物信息学管道自动分析来自CRISPR-Cas9筛选实验的NGS数据,使用MAGeCK进行统计分析。软件依赖项包括Python 3、Matplotlib、Cutadapt等。详细安装指南请参考git仓库链接。
CRISPR工具CRISPR筛选数据分析管道
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表格式界面挺友好的,不懂编程也能用。变量加减、数据清洗都能手动,比较适合那种日常做点数据的同学,是医学生、社科类专业,基本够用了。运行时响应也快,不卡顿。
还有一点我觉得不错,它挺“兼容”的。你平时的数据率是.xls或.csv格式的,对吧?直接拖进去就能用,不用转格式啥的,挺省事。完还能导出结果,直接拿去写报告。
不过要是你想搞深一点,比如多因素建模、机器学习
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文件导入支持.xls和.csv,兼容性还不错。遇到格式不标准的表格,它也能自动识别标题行,嗯,这点比不少老牌工具人性化。农业试验、理工类实验数据的时候挺高效的,尤其是多重比较那块,省了不少事。
图表输出也蛮丰富的,常规的条形图、折线图啥的都能搞,而且还能导出为图片。虽然不如Matlab和Python灵活,但对日常需求来说够用了。你要做个论文图,直接拿去也行。
对了,如果你平时用SPSS或者Minitab,
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