这是一个用MATLAB编写的软件包,专门用于神经回路在线闭环全光学询问。该软件由章子辉、劳埃德·罗素、奥利弗·高尔德和亚当·帕克在迈克尔·豪瑟实验室中开发。闭环界面(RTAOI)能够实时分析由Bruker Corporation的两光子显微镜采集的原始数据,并与Prairie View控制软件、自定义空间光调制器(SLM)控制软件(CL-Blink,基于Meadowlark Optics提供的Blink SDK)以及通过TCP/IP套接字进行通信的自定义感官刺激控制软件(StimPlayground_TCP)进行实时交互。用户可以选择感兴趣的区域(ROI)、指定实验协议并保存记录。该界面支持两种模式:开放显示和关闭显示。在开放显示模式下,界面会显示当前的钙图像和从ROI提取的钙痕迹。为了优化性能,在实验过程中建议关闭显示面板。使用该软件包可以进行活动钳位实验、触发目标实验等多种类型的实验。
MATLAB代码实现闭环三视图重建
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MATLAB 的fft2、ifft2这些函数在里面用得挺多,代码里也贴心配了几个滤波器的实现,比如Hamming和Shepp-Logan。如果你对图像质量要求高,稍微改改滤波器参数就行。响应也快,适合做算法原型。
需要注意一点,循环结构比较密集,尤其是用ART那块,for和while控制的更新迭代逻辑最好理清楚,不然容易卡逻辑。你可以从程序-改过文件入
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