schmid滤波函数matlab源码-HiC_tools一组Hi-C数据处理工具

这篇资源下载文章集合了与Hi-C数据分析相关的工具和论文，每个部分的工具都是最新的。内容涵盖了Java完整管道，可以将原始读取内容转换为Hi-C地图，并在Juicebox中进行可视化。该文档还详细介绍了调用域、循环、以及CTCF绑定站点的使用。.hic文件格式用于存储多分辨率的Hi-C数据。文献引用包括了Durand等人（2016年）和Rao等人（2014年）。欢迎发布和/或请求添加其他数据的请求！

导向滤波的 matlab 实现，真的挺实用的，尤其是搞图像的同学，应该都知道这个算法在边缘保留方面表现不错。这份guidedfilter.m资源，结构清晰、注释也比较友好，调试起来还挺方便的。 图像的细节增强、去雾、HDR 压缩这种场景都少不了导向滤波。你直接加载这个M 文件，给定引导图和原图，几个参数一设，滤波效果就能立马出来。 代码里的核心函数就是guidedfilter，基本是按论文原理一步步来写的，思路蛮清晰。如果你习惯用 OpenCV，也可以拿这个做参考，自己改写成 Python 版的。嗯，逻辑没那么绕，就是矩阵运算多点。 哦对了，下载资源的时候顺手看下这几个相关文章，也挺有用：

DataPie 是一款基于 C# 开发的高性能 Excel 导入和导出工具，支持与 MSSQL、Oracle 和 Access 数据库无缝对接，帮助您高效处理海量 Excel 数据。

Mongo数据处理工具是一款用于数据导出和导入的实用工具，支持多种数据格式和类型，操作简便，能够满足多样化的数据迁移需求。通过这个工具，用户可以高效地管理和转移Mongo数据库中的数据。

Logstash是一个由Elastic公司开发的强大开源工具，专为简化日志管理和分析而设计。它作为ELK堆栈的重要组成部分，能够从多种来源收集、处理和转发日志数据。Logstash工作流程包括输入、过滤和输出三个阶段：输入阶段支持文件、网络套接字等多种来源；过滤阶段提供丰富的插件支持，包括JSON解析、正则表达式匹配等；输出阶段可以将处理后的数据发送到Elasticsearch、syslog、数据库等多种目的地。其优点包括扩展性强、易于配置、与Elasticsearch和Kibana的良好集成，适用于监控服务器、应用程序和网络设备日志，提升日志管理效率和质量。

Matlab距离矩阵代码PSYCHIC使用Hi-C数据查找推定的增强子的代码。要运行此示例，请使用repo目录中的python htad-chain.py，配置文件格式为Hi-C文件的res分辨率（40000），互动距离截止点（通常为2000），染色体名称（例如'chr1'..'chrX'），使用染色体长度的床文件的chrsize路径（examples/hg19.size.bed）。conf文件（hIMR90）的output_prefix是输出前缀，output_dir为存储输出文件的路径（例如/输出），input_matrix为染色体的输入Hi-C矩阵路径（请参阅格式规范），genes_fi

这个工具能够将一列数据转换为单行格式，支持英文逗号分隔，默认转换为INSERT语句中VALUES()后的单引号逗号形式。以往在使用T-SQL时，通常需要手动复制到Excel进行转置，再替换空格为逗号，现在这个工具能够直接完成转换操作。

数据的 DPS 工具包，真的是搞科研、做统计的好搭档。安装包体积不大，装起来也快，界面虽然不算花哨，但功能还挺全。支持多变量、趋势预测啥的，用来跑点科研项目完全没问题。 DPS 数据系统的亮点在于它比较贴合中文用户的操作习惯，按钮、功能命名都接地气。尤其是那种常规的统计，比如方差、回归模型，点几下就能跑出结果，响应也快。 如果你习惯用 Excel 做基础，再把数据丢进 DPS，效率会高不少。而且你要是学过 MATLAB 或 SAS，基本能秒上手，思路像，语法不难。 对了，它也支持一些预测，用着比 Python 的 pandas + scikit-learn 套路简单多了，不用写长长的代码。适合

这是一组基于Matlab编写的相关InSAR数据处理程序，专为InSAR学习和研究人员设计，提供了丰富的数据处理功能。