这篇资源下载文章集合了与Hi-C数据分析相关的工具和论文,每个部分的工具都是最新的。内容涵盖了Java完整管道,可以将原始读取内容转换为Hi-C地图,并在Juicebox中进行可视化。该文档还详细介绍了调用域、循环、以及CTCF绑定站点的使用。.hic文件格式用于存储多分辨率的Hi-C数据。文献引用包括了Durand等人(2016年)和Rao等人(2014年)。欢迎发布和/或请求添加其他数据的请求!
Matlab源码实现Schmid滤波器-HiC工具HiC_tools
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