聚类分析是将对象分配到不同的簇中,使得同一簇内的对象相似,而不同簇之间的对象不相似。Weka在“Explorer”界面的“Cluster”提供了多种聚类分析工具,包括支持分类属性的K均值算法(SimpleKMeans)、DBSCAN算法(支持分类属性)、基于混合模型的EM算法、K中心点算法(FarthestFirst)、基于密度的OPTICS算法、概念聚类算法Cobweb、基于信息论的sIB算法以及自动确定簇个数的扩展K均值算法XMeans(不支持分类属性)。
聚类分析工具 - 数据挖掘的利器(Weka教程)
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聚类分析是将对象分配到不同的簇中,以使同一簇内的对象相似,不同簇间的对象则不相似。WEKA的“Explorer”界面提供了多种聚类分析工具,包括支持分类属性的K均值算法SimpleKMeans,分类属性的DBSCAN算法DBScan,基于混合模型的EM算法,K中心点算法FathestFirst,基于密度的OPTICS算法,概念聚类算法Cobweb,以及基于信息论的聚类算法sIB。另外,XMeans算法能够自动确定簇的个数,但不支持分类属性。
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提到聚类的实现,Matlab 的相关工具也挺有。比如基于 Matlab 开发的 MSKCC GDSC 癌症基因组学数据工具,它了一个简便的环境来运行各种数据挖掘算法。如果你有类似的需求,参考一下这类工具会比较方便。也可以看看一些关于数据挖掘和基因组的相关文献,了解聚类的不同实现方式和优化方法。
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