Matlab集成的C代码介绍了FASTCORE算法家族,这些算法可以基于通用的基因组规模的代谢重建及输入数据来重建上下文特定的代谢模型。详细信息可参见: - FASTCORE (Vlassis et al., 2014, PloS Computational Biology) - FASTCORMICS (Pacheco et al., 2015, BMC Genomics) - Benchmarking (Pacheco et al., 2016, Frontiers in Physiology) - rFASTCORMICS (Pacheco et al., 2019, EBioMedicine)。最近的更新是在2021年4月26日。rFASTCORMICS是一种基于RNA序列数据重建特定情境的代谢模型的算法,类似于FASTCORMICS的微阵列数据,但更适合FPKM转换的RNA序列数据。软件要求:Matlab 2013或更高版本。