显微图像

MATLAB 的 fP 风格加上HDL Coder，用来做显微图像，还挺香的。尤其是做形态学梯度这种操作，用硬件加速，速度提升那是立竿见影。项目里通过先膨胀、再腐蚀，一减，搞定边缘提取这一块。蛮适合你在做微观结构识别或者图像增强方面的任务，比如灰度图像里的细胞边界。用morp_gradient文件里封装好的逻辑，可以直接跑，而且验证部分也做得挺扎实的，省你不少时间。如果你用的是FPGA或者其他嵌入式设备，HDL Coder 能帮你把 MATLAB 代码转成Verilog或者VHDL，部署硬件也方便多了。推荐你用 MATLAB 的Test Manager去跑一遍测试，兼容性和准确率都比较稳。项目

这段代码可以从SEM图像中提取纤维的直径分布数据。所有长度单位均以微米为单位。该代码会生成一个excel文件，其中包含所有测量的纤维直径。 使用该代码，您唯一需要设置的参数是图像的空间分辨率。要计算空间分辨率，请将图像的实际高度除以图像以像素为单位的高度。例如，如果图像的高度为 1000 像素，实际高度为 100 微米，则空间分辨率为每个像素 0.1 微米。 如果您在您的研究中使用了此代码，请引用以下论文： Rabbani, A. & Salehi, S. (2017). 地层动态建模损伤理论和泥饼沉积，采用过滤理论并结合 SEM 图像处理。天然气科学与工程杂志，42, 157-168.

使用Fourier Ptychography算法优化傅里叶叠层显微图像的恢复过程，以提高图像重建的精度和效率。这种技术利用多角度光学信息，通过数学模型重建高分辨率图像，适用于生物医学和材料科学领域的研究。

在matlab中使用tif图像处理，细胞之星是一款专门用于自动跟踪细胞的软件。为了研究各种生物学问题，特别是在限制细胞系制备操作和光毒性成像期间，通常采用明场成像。CellStar经过优化，能够有效分割和跟踪单层生长的出芽酵母细胞图像，同时也适用于其他圆形物体的跟踪，无论是在明场还是荧光图像中。该软件的关键在于其灵活的参数拟合机制，使其可以针对多种图像类型进行训练和应用。详细信息请访问我们的网站。

MIST是一个拼接2D图像数据集的工具，专为显微镜图像设计。它支持将时间序列数据处理为独立的数据集，并且能够处理具有10%重叠的图块。该工具的第一个版本为ImageJ / Fiji插件，未来将推出独立工具。该存储库包含两个分支：一个为插件的源代码，另一个为MATLAB原型的源代码。更新至CUDA 9.0将提升性能，特别是在现代GPU上。关于安装说明和用户指南，请参见快速导航中的相关信息。

读取tiff图像堆栈：使用Matlab函数ReadTiffStack('绝对文件名')来加载数据集，然后通过GUI界面浏览图像堆栈。这种方法允许用户方便地探索和分析延时显微镜捕获的数据序列。

这个脚本专注于利用MATLAB的内置功能，将实验显微照片分割为离散的局部状态，以支持PSP工作流程（即空间相关性）。随着时间推移，它还添加了图像预处理和分割后处理等通用材料信息学用例的功能。

高光谱CARS显微镜和光谱工具箱使研究人员能够方便地分析他们的数据。该工具箱专注于图像融合、去噪和光谱学的研究与开发。

MATLAB 代码用于处理点击扩展显微镜数据。包括刚性配准、膨胀因子计算、B样条非刚性配准、畸变场计算和均方根误差计算。

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