分子结构

分享了MATLAB绘制分子结构的源程序代码，详细介绍了如何利用MATLAB进行分子结构的图形绘制。具体程序代码请参见附件。如需获取资料或有任何疑问，请联系我QQ 1530497909。

ReadSTP 允许您从分子成像原子力显微镜 (AFM) 文件中提取选定的数据缓冲区，并将数据加载到 MATLAB 矩阵中，方便后续分析和处理。

分子对接的数据库准备和配体、受体的预，挺像前端开发里拉接口、清数据、调结构的那一套。ZINC、PubChem 这些数据库就像是组件库，直接拉来就能用。配体准备也蛮有意思的，2D 转 3D、加氢加电荷、调 pH 值，就像一张图，要加滤镜、调光、裁剪，变得适合对接这个“前端页面”了。受体准备更讲究，要去水、找口袋、调电荷，像是写布局前先要把容器好。这些环节看似小事，其实决定了后面对接的成败，别小看哦！

Primer5.2 的引物设计功能挺实用的，适合做分子实验的朋友。你只需要把 DNA 序列丢进去，设定下长度、Tm 值、GC 含量，软件就能自动帮你筛出一对靠谱的引物，特异性还挺高，省了不少试错的功夫。 序列那块也不错，DNA、RNA、蛋白质都能搞定。导入序列后能直接比对、翻译、注释，甚至还能自己编辑序列，用起来蛮顺手的，适合整理大段序列数据。 PCR 优化方面，Primer5.2 能预测产物大小，还能退火温度、Mg²⁺浓度这些参数。做 PCR 的应该知道，这些条件调不好，效率和特异性都白搭，Primer5.2 能帮你提前踩坑。 测序质量也有，能看出污染、多峰、低质量区域。是做高通量或是 NG

SCFT2D 是进行高分子材料模拟的一个强大工具，适用于 AB 二嵌段共聚物的结构与性质研究。如果你对高分子系统和自洽场理论感兴趣，这个 MATLAB 开发项目绝对值得一试。SCFT 方法通过考虑溶剂与高分子链的相互作用，精确模拟复杂系统的行为，是在薄膜、胶束等高分子材料的相行为中表现得尤为重要。你可以用scft_AB_2D.m这个主脚本来实现计算，还能通过simpson2d.m来进行积分计算。整体上，这个工具挺适合做科研实验，尤其在物理化学、材料科学中应用广泛。如果你正打算进行高分子材料研究，试试看，会有惊喜哦。

MDToolbox是专为MATLAB和Octave设计的工具箱，用于分析分子动力学轨迹的统计特性。它提供了丰富的功能，帮助研究人员深入理解分子系统的动态行为。MDToolbox支持多种数据分析技术，为科学家们在研究复杂生物分子相互作用和结构动态性方面提供了强大的工具。

基于信息可视化软件，分析了2000-2019年分子筛领域27519篇英文文献，绘制了知识图谱，揭示研究热点和新趋势。

modelled_systems modelled_systems是一个汇集了参考和规范数据的仓库，用于分子计算分析和模拟，涵盖： 实验结构 建模对接 MD模拟结构 分析和数据挖掘 该仓库以“系统”集合的形式组织在systems文件夹中。每个文件夹代表一个独特的系统，其名称 (system_id) 可作为其他情况下的参考标识符。 系统篇 “系统”的定义 “系统”是指一组独特的目标化学物质，通常对应于单个RCSB PDB ID（例如BTK-cIAP-TL7例子中的6w7o）。系统包含构成主要研究对象的成分，例如蛋白质和小分子，而不包括结晶水等次要成分。

LAND 软件包对单分子定位显微镜 (SMLM) 数据进行定量分析，尤其适用于处理大样本量和高发射体密度的数据。 功能 2D 和 3D SMLM 数据分析算法: 基于密度的噪声应用空间聚类 (DBSCAN) 基于 Voronoi 的聚类分析 里普利函数 径向分布函数 (RDF) 最近邻分析 (NN) 距离分析 用于量化核纳米结构构象和纹理的算法 (SMLM-ConText) 数据可视化 具有批处理功能的用户界面 软件获取与安装 下载软件包并解压缩 LAND-master.zip 文件。 将生成的 LAND-master 目录复制到本地 MATLAB 工作目录中。 在 MATLAB 命

原子力显微镜测量链霉亲和素-生物素复合物的断裂力。采用常规方法和模糊逻辑算法处理力曲线，以确定断裂力的分布。基于模糊逻辑的分析消除了热噪声伪影，从而得出更高的断裂力。研究表明，方法的选择会影响对配体-受体相互作用的理解。