ATP代谢

用于高强度运动模拟的 ATP 生成 matlab 模型挺值得一试的。这个项目一看就是懂行的人写的，两个模型都考虑到了酶的限制，还结合了蛋白质组学数据，模拟挺贴近实际的。尤其是它那个全身代谢模型，连复合 I 的旁路都加进去了，挺少见的。 酶约束的代谢模型在研究代谢瓶颈时有用。像这种结合HMR2.00数据源、还能预测vO2max、乳酸阈值变化的，真的不多。你要是搞FBA或者在做运动代谢模拟，这个代码库还蛮合适的。响应也快，结构清晰，拿来改一改直接用。 有一点值得注意哦，它主要聚焦在酶活性约束上，适合想精细模拟 ATP 产量变化的场景，比如不同运动强度下的能量分配。代码逻辑也还算清楚，尤其适合你用来

血清胆碱、葡萄糖、三甲胺升高，脂质、乳酸、糖蛋白、丙氨酸下降 尿液葡萄糖、柠檬酸、牛磺酸、肌氨酸升高，马尿酸、肌酸降低

通过改进一般灰色预测，在新陈代谢中实现趋势项的预测，以提高时间序列预测的准确性。

MetMAP是一个专为代谢建模、分析和优化而设计的MATLAB工具包。它允许您从理论角度研究代谢系统，分析通路的结构和动力学。此外，您还可以利用该工具包进行生物技术应用，评估遗传改良过程中的最佳解决方案。所有这些计算都基于S系统形式主义（生化系统理论的一部分，即BST）和间接优化方法（如Torres、Voit等人开发的IOM）。更多信息请访问我们的网站：http://webpages.ull.es/users/sympbst/pag_ing/metmap.htm

在全合成培养基中，甘氨酸作为限制性氮源，利用GC-MS分析方法分析了大肠杆菌野生型菌株Y1.1566和琥珀酸脱氢酶基因缺失突变株AsdhAB(S)的胞内代谢产物。多变量统计分析表明，两株菌的代谢产物中至少8种化合物显著变化，尤其是D-葡萄糖苷的变化最为显著。对检测到的主要细胞内氨基酸进行相关分析后发现，脯氨酸、异亮氨酸和谷氨酰胺的关系显著变化，可能是为了适应渗透压变化的需要。