用于高强度运动模拟的 ATP 生成 matlab 模型挺值得一试的。这个项目一看就是懂行的人写的,两个模型都考虑到了酶的限制,还结合了蛋白质组学数据,模拟挺贴近实际的。尤其是它那个全身代谢模型,连复合 I 的旁路都加进去了,挺少见的。
酶约束的代谢模型在研究代谢瓶颈时有用。像这种结合HMR2.00
数据源、还能预测vO2max
、乳酸阈值变化的,真的不多。你要是搞FBA
或者在做运动代谢模拟,这个代码库还蛮合适的。响应也快,结构清晰,拿来改一改直接用。
有一点值得注意哦,它主要聚焦在酶活性约束上,适合想精细模拟 ATP 产量变化的场景,比如不同运动强度下的能量分配。代码逻辑也还算清楚,尤其适合你用来配合实际运动数据做拟合。
如果你平时也用MATLAB
搞代谢建模、蛋白质或运动生理研究,真的可以看看。顺便一提,相关资源像是 fastAlign、iSanXoT 也可以一起用,效果会更完整。
如果你刚好在找能模拟复合 I
旁路、又支持蛋白质组数据输入的代谢模拟工具,这个仓库还挺靠谱的,可以上手看看。