细胞黏附力

研究背景：本研究通过显微形态学观察、计算机图像处理技术和数据统计分析，对肝癌细胞在融合生长过程中的形变调节趋势进行了定量表征。同时，通过细胞力学和生化检测，探究细胞黏附力与整合素的表达对肝癌细胞重叠生长的影响。实验结果：1. 肝癌细胞的运动变形能力显著强于正常肝细胞，其融合生长层内可观察到大量圆形细胞，且这些圆形细胞易于聚集。2. 肝癌细胞株HepG2的Integrin β1表达水平显著高于正常细胞株LO2。3. 重叠区域中的圆形细胞黏附力显著低于周边铺展细胞。4. 纤维连接蛋白（Fibronectin，Fn）对HepG2的Integrin β1表达有下调作用。5. 经Fn裱衬后，HepG2细

此存储库包含用于Matlab的灰度处理和细胞跟踪的源代码。该程序支持荧光或暗场电影的处理，以及相衬电影的跟踪。兼容Matlab 2018a及更早版本，支持'.tif'堆栈和'.nd2'文件格式。还提供适用于Linux的版本。

【细胞分割】基于分水岭算法的细胞分离计数matlab程序及GUI.zip

用于重叠巨噬细胞分析的MATLAB软件包。

此函数以16位TIFF堆栈形式接收图像，并通过解交错处理其三个通道。它对核标记和病原体通道进行阈值处理和分水岭分割，以识别细胞核和细菌。然后，该函数使用病原体质心创建目标区域（ROI），并通过子图像提取病原体周围的细胞内信号。

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【细胞分裂】利用形态学算法开发的matlab源码，可用于红细胞计数，并提供了直观的GUI界面。

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尽管物体检测已在多个行业产生影响，但在使用巴氏涂片显微镜检测癌细胞方面仍存在挑战。本项目引入了一种机器学习算法，能够在检测和裁剪感兴趣区域（ROI）之前自动检测异常细胞特征。使用宫颈细胞的数字图像，我们通过以下三个关键步骤实现ROI的自动识别：（I）应用于RGB显微照片的非线性过滤器；（II）基于图的聚类（Felsenszwalb算法）；（III）Isodata二进制分类定义超像素。该过程的平均精度达到92%，平均召回率为95%。这一算法是未来智能显微镜电动载物台的核心驱动力，能够扫描完整的载玻片。详见Efficient_Graph_Poster_19.pdf。

这个存储库包含用于3D单细胞分割和分析的Matlab代码，附有详细的步骤说明。分割分段器是一个用于Matlab的应用，通过阈值化细胞质标记物或膜标记物的分水岭转换，在3D空间中精确分割细胞。用户界面简单易用，允许调整参数以达到最佳分割效果。分析脚本可应用于图像文件夹，并将结果保存为Excel文件，包括通道的阈值识别点和区域的富集和部分重叠分析。