SNP标记

马氏距离matlab原始代码引文GTASSIST：大规模SNP基因分型的基因标记选择的客观评估措施Kaminuma E，Masuya H，Miura I，Motegi H，Takahasi KR，Nakazawa M，Matsui M，Gondo Y，Noda T，Shiroishi T，Wakana S，Toyoda T J Bioinform Comput Biol。2008 6：905-17。执照瑞肯：保留所有权利。请检查。联系信息如果您对GTASSIST软件有任何疑问，请向国家遗传学研究所和RIKEN BRC咨询。GTASSIST指令&< GTAssist>> GTAssist是在SN

极客标记系统挺有意思的，主要是为了标记管理和快速部署功能的。它支持通过 CouchDB 存储，方便高效。安装过程也蛮简单，直接运行一些命令就能搞定：npm install -g gitinspector、npm install couch-admin等。配置好之后，你可以灵活地使用这个系统管理数据，搭配其他工具比如pouchdb、uglify-js优化代码，效率高。感觉它适合需要高效标记管理的场景，比如开发过程中对数据标记的追踪和管理哦。另外，它还支持和其他技术结合使用，像pg、bluebird这样的数据库和异步库都能好的配合。不过要注意的是，CouchDB 的安装和配置需要稍微留意，毕竟它是

酶切位点筛选的脚本，挺适合搞 SNP 标记开发的你。它的核心就是把SNP 位点转成CAPS 标记，也就是让原来只能用 HRM 搞的东西，变得更通用一点。你只要准备好已知的 SNP 位点，它就能帮你筛选出合适的酶切位点，起来还蛮快的，省了不少手工比对的麻烦。 比起传统的 HRM 方法，这种CAPS 转换方案更稳定，也方便后续扩展。尤其适合在没有太多高通量设备的实验室环境里搞事情。代码逻辑清晰，脚本结构也不复杂，就几个关键函数，改起来也方便。 如果你对标记管理感兴趣，可以顺手看看极客标记标记管理工具，工具界面简单，功能挺实用的。另外像GTASSIST这样的资源也不错，对遗传标记选择有不少经验总结。

dbSNP数据是指一条具体的多态性位点数据，如图1所示，其中间行表示多态性位点，R代表嘌呤（即G或A）。图1中使用了IUPAC的代号。

在原始图像基础上，利用病变的二值图像，精确标定并展示病变区域的边缘及其位置。该过程适用于Matlab环境。

Matlab开发中的日期标记功能允许在放大或缩小操作后自动调整时间日期标记，解决了勾号标签的问题。

标记修改行状态的 DataSet 用法，还挺实用的。你在用DataSet操作数据库时，经常需要判断某一行是不是被改过。直接用RowState属性就能搞定，比如dataSet.Tables["students"].Rows[0].RowState，返回的状态能告诉你是新增的、改过的、删掉的还是压根没动过。

病理标本上的墨迹标记自动检测与数字映射工具，可用于： 检测并编辑墨迹边界 注册带墨迹图像到未带墨迹图像（可选） 提供手动标记墨迹边界的功能（可选）

人类皮肤颜色的 SNP 统计数据挺有意思的，尤其是对搞前端可视化的你来说。数据结构清晰，字段命名也规整，拿来喂进可视化库完全没压力。用来练习Echarts或D3.js都挺合适，尤其是要搞那种基因分布图、族群差异图之类的。统计工具方面，Excel、SAS、SPSS 这些都能搞，尤其是 Excel 的表格格式化，前期预比较顺手。而且数据量不是大，日常测试也够用。如果你还不熟 SNP（单核苷酸多态性）是啥，简单说就是基因里一个碱基的位置不一样，比如 A 换成了 T，结果就是肤色深浅的差异。用来做热图、对比图，图表效果直观。建议你配合一些统计工具用，像是SPSS做前期，Excel改一下格式，丢给前端做

在Matlab中，可以创建日期格式刻度标签，使其在缩放或平移时自动更新，帮助用户方便地处理带时间序列的数据。