钙成像

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MATLAB Zebrafish Spinal Cord Development钙成像数据框架
Zebrafish_spinal_cord_development 是个挺实用的 MATLAB 框架,专门用于斑马鱼脊髓发育的钙成像数据。这个框架有两个模块:图像和信号,每个模块里有几个子模块,你根据实际研究需求进行数据和。图像模块偏重于图像数据的提取和,可以在远程服务器上并行大规模数据。信号模块则全自动地对提取的数据进行进一步,你深入了解数据背后的统计特性和数学模型。如果你正在研究类似领域,能够根据框架的指南进行配置和使用,你快速上手,节省不少时间。如果你是刚接触这块的,别担心,框架的设计相对简单,而且文档也挺详细,是有一份指南教你如何设置环境并使用每个模块。要是你在调试过程中遇到问题,还可
CIAtah软件包钙成像数据集分析的新工具
CIAtah(发音为cheetah;以前是calciumImagingAnalysis [ciapkg])是用于对单光子和双光子成像数据集进行钙成像分析的软件包。最新代码可在GitHub上找到:https://github.com/bahanonu/calciumImagingAnalysis。请参阅GitHub或https://git.io/ciapkg_docs获取详细自述文件和信息。软件包包括GUI,允许用户执行大规模批处理分析,可通过存储库中的“calciumImagingAnalysis”类访问。还提供命令行就绪的分析管道。主要功能包括预处理、细胞提取、细胞分类等。此外,还包括用于动
Python工具箱fissa用于快速图像信号分离分析,专为钙成像数据设计
菲萨是一个Python工具箱,专为快速图像信号分离分析(FISSA)而设计,特别适用于处理双光子钙成像数据中的细胞体信号。它支持从tiff格式图像和导出的zip文件中的ROI读取图像,也可以处理numpy数组。菲萨兼容Python 2.7及以上版本,并推荐使用Python 3。在Ubuntu、Windows和Mac OSX系统上进行了广泛测试。详细API文档可在线获取。
快速钙尖峰插值钙活性归一化和快速插值技术
该程序从钙成像数据的感兴趣区域提取荧光水平的平均值。在刺激前的基线水平用于将数据标准化为基线百分比,并使用基线Ca2+活性的标准偏差。通过固定刺激间隔的重复刺激,结合已知的扫描和采样时间,可以进行Ca2+尖峰的快速插值。数据格式为.txt文件,并可保存为.tif和.ai格式的图像,以及.xlsx表中的规范化值。程序将重复刺激后的数据进行叠加,并采用选择的插值方法对响应进行内插。
聚束SAR成像技术及其成像指标分析
聚束SAR(Synthetic Aperture Radar)成像技术在雷达成像领域具有重要应用,其成像指标包括分辨率、覆盖范围和数据处理速度等关键参数。聚束SAR成像技术通过合成孔径雷达技术实现高分辨率的地面目标探测,广泛应用于地质勘探、环境监测和灾害评估等领域。
解析分子成像 AFM 文件
ReadSTP 允许您从分子成像原子力显微镜 (AFM) 文件中提取选定的数据缓冲区,并将数据加载到 MATLAB 矩阵中,方便后续分析和处理。
超声成像工具箱优化
Matlab超声成像波束合成工具箱Beamformation Toolbox。本目录包含用于超声成像的工具箱。当前目录包括:文档目录(PDF、HTML格式)、bft_*.m文件集、示例目录、C文件目录和头文件目录。
钙钛矿电催化的DFT分析及Python源码探索
该项目包含了使用密度泛函理论(DFT)计算的钙钛矿型电催化剂的电子结构特性。存储库中的Python代码和原始数据可用于重现Zheng Li、Luke E. Achenie和Hongliang Xin的研究成果。其中,'density_state_descriptor.py'文件包含状态电子密度的特征函数,而'compositional_descriptor.py'文件则描述了钙钛矿结构中原子性质的相关信息。项目还提供了'train.csv'和'test.csv'文件,用于模型的训练和预测。
SAR成像MATLAB代码简介
关于我:你好,我是TY,毕业于梨花女子大学,主修机械与生物医学工程,辅修计算机科学工程。我对深度学习、机器学习、计算机视觉和自然语言处理等领域特别感兴趣。在技术博客和GitHub上分享我的研究成果和项目经验。我曾获得多个奖项,包括2020年ICT Kok AI Contest的二等奖和2020年KISTI研究数据• AI分析应用大赛的二等奖。持有ADsP(高级数据分析半专业)证书。
X射线成像系统几何校准的Matlab实现
该项目提供了用于X射线成像系统几何校准的Matlab实现方法和算法,灵感源自于Li、新华、张大和Bob Liu的研究成果。安装方法包括将函数文件(solveGeo.m)拖入项目或添加至Matlab函数搜索路径。使用示例可通过查看提供的示例了解脚本的具体操作。该函数能够输出在探测器坐标系中x射线焦点位置(以像素为单位)x、y和z的三个值,对于加载校准体模特征的3D坐标特别有用。