AFM

如果你正在 AFM（原子力显微镜）图像，MATLAB 的强大功能可以你轻松和提取有价值的数据。AFM 图像一般是由垂直位移数据点组成，MATLAB 的图像库了好用的工具来这些图像。比如，你可以用imread加载图像，imshow来展示，imhist来查看图像亮度分布。噪声去除方面，MATLAB 了如wiener2、medfilt2等滤波器，能够你清理图像。再比如，图像校准、特征提取等方面也都不在话下，regionprops函数可以让你轻松计算各种几何特征，进一步表面粗糙度或其他表征指标。，图像分割也是常见的需求，MATLAB 的imbinarize和edge函数都能在这方面支持。数据可视化方面

ReadSTP 允许您从分子成像原子力显微镜 (AFM) 文件中提取选定的数据缓冲区，并将数据加载到 MATLAB 矩阵中，方便后续分析和处理。

您是否曾经需要基于时间的原子力显微镜测量？您可以通过固定在位的AFM探针监视样品上的变化。但是，通常的AFM软件要么不支持时间记录，要么限制了高采样率。我们介绍Asylum软件，它具备记录功能，可以实时监测并保持采样率同步。此外，通过在小区域进行扫描并设置适当的扫描速率和图像分辨率，您可以实现超过常规限制的高采样率，捕捉快速变化。

打击迹线的 SmarTrace 的 Matlab 代码挺适合做单分子，尤其是搞AFM 图像的朋友。界面借了EasyWorm GUI的思路，操作比较直观。只要你用过Matlab 2018a或更新版，直接把文件夹扔进路径里就能跑。 嗯，SmarTrace 专门用来追踪那种明亮的链状结构，像胶原蛋白或者 DNA 的纤丝图，背景偏暗的图也没问题。想试试？先装好深度学习工具箱，再把图像放到同一目录，省得路径出错。响应也快，代码也简单，算是入门和进阶都适合的一个工具。 如果你还想了解更多，推荐你看看它的论文，或者去找找类似的工具，像AFMunroll或者BayesPI，都挺有意思的。