大分子分析

该工具箱利用一对DOSY光谱，分别记录在假定配体混合物和包含该混合物及大分子的样品上，通过匹配两个光谱之间的DOSY峰，并应用聚类分析来检测哪些假定配体实际与大分子结合。CoLD-CoP甚至可以在存在低大分子浓度的情况下检测大于10 mM的结合常数。这项研究将在J. Magn. Reson.上发表 (DOI：10.1016/j.jmr.2015.03.005)。

ReadSTP 允许您从分子成像原子力显微镜 (AFM) 文件中提取选定的数据缓冲区，并将数据加载到 MATLAB 矩阵中，方便后续分析和处理。

MDToolbox是专为MATLAB和Octave设计的工具箱，用于分析分子动力学轨迹的统计特性。它提供了丰富的功能，帮助研究人员深入理解分子系统的动态行为。MDToolbox支持多种数据分析技术，为科学家们在研究复杂生物分子相互作用和结构动态性方面提供了强大的工具。

基于信息可视化软件，分析了2000-2019年分子筛领域27519篇英文文献，绘制了知识图谱，揭示研究热点和新趋势。

在大数据处理场景下，特别是使用Hive建设数据仓库时，有效管理数据分区至关重要。为了高效管理和查询数据，有时需要确定表中的最大分区。将详细介绍如何使用Hive中的用户定义表生成函数（UDTF）来实现此功能。UDTF是一种特殊的用户自定义函数，能够输出多行或多列结果集，对处理复杂业务逻辑非常有帮助。通过编写Java代码实现UDTF，我们可以遍历所有分区并找出最大的一个。

原子力显微镜测量链霉亲和素-生物素复合物的断裂力。采用常规方法和模糊逻辑算法处理力曲线，以确定断裂力的分布。基于模糊逻辑的分析消除了热噪声伪影，从而得出更高的断裂力。研究表明，方法的选择会影响对配体-受体相互作用的理解。

LAND 软件包对单分子定位显微镜 (SMLM) 数据进行定量分析，尤其适用于处理大样本量和高发射体密度的数据。 功能 2D 和 3D SMLM 数据分析算法: 基于密度的噪声应用空间聚类 (DBSCAN) 基于 Voronoi 的聚类分析 里普利函数 径向分布函数 (RDF) 最近邻分析 (NN) 距离分析 用于量化核纳米结构构象和纹理的算法 (SMLM-ConText) 数据可视化 具有批处理功能的用户界面 软件获取与安装 下载软件包并解压缩 LAND-master.zip 文件。 将生成的 LAND-master 目录复制到本地 MATLAB 工作目录中。 在 MATLAB 命

分子对接的数据库准备和配体、受体的预，挺像前端开发里拉接口、清数据、调结构的那一套。ZINC、PubChem 这些数据库就像是组件库，直接拉来就能用。配体准备也蛮有意思的，2D 转 3D、加氢加电荷、调 pH 值，就像一张图，要加滤镜、调光、裁剪，变得适合对接这个“前端页面”了。受体准备更讲究，要去水、找口袋、调电荷，像是写布局前先要把容器好。这些环节看似小事，其实决定了后面对接的成败，别小看哦！

Primer5.2 的引物设计功能挺实用的，适合做分子实验的朋友。你只需要把 DNA 序列丢进去，设定下长度、Tm 值、GC 含量，软件就能自动帮你筛出一对靠谱的引物，特异性还挺高，省了不少试错的功夫。 序列那块也不错，DNA、RNA、蛋白质都能搞定。导入序列后能直接比对、翻译、注释，甚至还能自己编辑序列，用起来蛮顺手的，适合整理大段序列数据。 PCR 优化方面，Primer5.2 能预测产物大小，还能退火温度、Mg²⁺浓度这些参数。做 PCR 的应该知道，这些条件调不好，效率和特异性都白搭，Primer5.2 能帮你提前踩坑。 测序质量也有，能看出污染、多峰、低质量区域。是做高通量或是 NG

打击迹线的 SmarTrace 的 Matlab 代码挺适合做单分子，尤其是搞AFM 图像的朋友。界面借了EasyWorm GUI的思路，操作比较直观。只要你用过Matlab 2018a或更新版，直接把文件夹扔进路径里就能跑。 嗯，SmarTrace 专门用来追踪那种明亮的链状结构，像胶原蛋白或者 DNA 的纤丝图，背景偏暗的图也没问题。想试试？先装好深度学习工具箱，再把图像放到同一目录，省得路径出错。响应也快，代码也简单，算是入门和进阶都适合的一个工具。 如果你还想了解更多，推荐你看看它的论文，或者去找找类似的工具，像AFMunroll或者BayesPI，都挺有意思的。