3D渲染器

Mitsuba 的飞行时间渲染器MitsubaToFRenderer还挺有意思的，用 MATLAB 也能搞定复杂的椭球场景渲染，效果还蛮惊艳。它支持用 Docker 一键跑，推荐用adithyapedireda/mitsubatofrenderer这个镜像，预装好了环境，Windows、Mac、Ubuntu 都能跑，省事不少。 本地装也行，在ubuntu16.04和ubuntu20.04上都测试过，按照INSTALL.txt和INSTALL_20.04.txt走一遍就行。运行参数啥的看下USAGE.txt，写得比较清楚，适合直接上手调试。 渲染完的.exr图还能直接转视频，脚本在INSTALL

MATLAB代码实现基本软件的3D渲染器，支持OBJ文件加载、环境照明、镜面照明、物体旋转和相机运动，可生成多种渲染输出（包括ASCII、PNG和SFML窗口，带操作系统API）。目前不支持实时输出切换，但可通过两次渲染获得光源和相机不同视角下的阴影效果。尚待解决的功能包括纹理贴图、透视插值的正确处理和更优的UI控件设计。未来计划将代码编译为WASM或实现客户端/服务器模型，在Web平台上运行。

这是一个用于可视化来自mhd文件或ImageType格式工作区的医学图像的3D和4D查看器。其特性包括3D/4D图像可视化、图像叠加、斜切以及3D切片的可视化，还支持基本的刚性注册。推荐与医学图像处理工具箱（如下确认）一起使用。例如： >> im1 = read_mhd('BMode_ultrasound_4D.mhd'); >> im2 = read_mhd('ColorDoppler_ultrasound_4D.mhd'); >> SimpleViewer_GUI然后选择文件->从工作区打开。最新版本可在以下位置找到： https://gitlab.com/compounding/matl

非常实用的3D粒子插件，这款插件能够精确追踪摄像机的动态，为3D场景增添了更多的现实感和动态效果。

利用图像导数分割密集3D组织中的细胞核。输入为一系列时间成像的z切片，格式为tiff或lsm。基于图像导数进行初级分割后，计算3D属性，并推断分割对象的图像统计数据。聚类方法解析融合的原子核为单个原子核（计算时间较长）。详情见已发表研究文章《3D胚胎成像中的对象分割和地面真相》。

这个工具允许用户交互式地查看各种2D、3D和4D图像体积，如CT和MRI。用户可以在2D切片中进行分割、测量距离或选择感兴趣区域(ROI)。它包括最大强度投影(MIP)、体积渲染(VR)、切片渲染以及彩色和Phong着色体积渲染。体素不透明度和颜色表可以即时调整，还支持iso表面渲染。这种快速渲染算法基于Matlab编码的剪切变形实现，而不是传统的旋转观察者光线方式。

此程序汇集了不同颜色通道中细胞计数的结果，以便从Excel表格中快速计算细胞活力。该程序还评估了ImageJ可行性宏中收集的细胞活力数据，准确地量化了3D培养中细胞活力，通过cLSM显微镜扫描，将堆栈分为独立通道，并在每个图像中使用定制的ImageJ宏（Cellcounter3D）分析细胞活力。

以imshow3D开头的图像展示工具，还挺适合想搞点 3D 花活的你。它跟imshow()差不多用法，但可以把图像贴到球体、圆柱体或者你自己定义的形状上。嗯，是那种真的贴上去，不是 PPT 上的“拟物效果”。默认是贴在一个圆柱体上，但你也可以自己传x, y, z坐标或者一个半径函数，来生成像圆锥、球体这种自定义表面。代码也不复杂，响应还快，配合colormap还能调出各种风格，热力图那种效果也有。举个例子：I = peaks(); imshow3D(I,'shape','sphere','colmap',hot(256)); 这样图像就能包裹在一个热热的球体上了，视觉效果直接。你也可以自己写个

DirectX 项目里的老朋友——d3dx9_43.dll，做图形渲染的你应该不陌生。这个库主要配合 DirectX 9 使用，像加载网格、纹理、搞个贴图啥的，都离不开它。 d3dx9_43.dll 是微软官方的动态链接库，多老项目还在用，是用到 HLSL 或需要跑在 Win7/Win10 上的游戏或者仿真软件。如果你看到“程序无法启动，因为缺少 d3dx9_43.dll”，嗯，基本就是它没装全。 要注意，这玩意儿不是自己复制一下就行的，得装个 DirectX Redist，或者用 DXSDK 里的安装包。手动搞不干净，还容易出现奇怪的兼容问题。 如果你在折腾跟 3D 有关的东西，像 Hats

3D 图像的 Haralick 特征提取，cooc3d 这个 MATLAB 小工具还挺方便的。它能把传统的 2D 纹理算法扩展到三维，直接帮你搞定共生矩阵那一套。你只要给它一份 3D 图像的灰度矩阵，它就能输出一堆纹理特征，像什么对比度、同质性这些，做分类、识别都挺好用。 cooc3d.m是主力函数，逻辑清晰，注释也不少。读取 3D 图像、计算共生矩阵、提取 Haralick 特征，全流程一条龙。你可以直接扔进自己的图像流程里，比如医疗 CT、地质勘探建模这些都挺适配。 用法也不复杂，cooc3d 了一些demo 数据和测试脚本，基本上照着跑一遍就能懂。如果你熟 MATLAB，应该几分钟就能上