此程序汇集了不同颜色通道中细胞计数的结果,以便从Excel表格中快速计算细胞活力。该程序还评估了ImageJ可行性宏中收集的细胞活力数据,准确地量化了3D培养中细胞活力,通过cLSM显微镜扫描,将堆栈分为独立通道,并在每个图像中使用定制的ImageJ宏(Cellcounter3D)分析细胞活力。
基于3D支架的细胞活力估算器
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用户还可以自定义颜色级别,通过传入NUMBER_COLOR_LEVELS参数调整颜色的细分。例如:
X = linspace(-10, 32);
Y = linspace(0, 32);
Z = linspace(0, 32);
U = linspace(-1, -5, 32)
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imshow3D(I,'shape','sphere','colmap',hot(256)); 这样图像就能包裹在一个热热的球体上了,视觉效果直接。你也可以自己写个
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代码功能:
加载三维模型数据
定义随机游走参数(例如,步长、游走次数)
执行随机游走模拟
计算模型上点之间的距离或相似性矩阵
可视化匹配结果
使用方法:
将三维模型数据文件(例如,.obj, .ply)放置在代码所在目录下。
修改代码中加载数据的路径和文件名。
设置随机游走参数。
运行代码。
注意:
代码需要安装Matlab环境才能运行。
可以根据需要修改代码,例如,使用不同的距离度量方法或可视化方式。
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实现方式比较纯粹,Matlab写的,结构清晰,适合拿来做二次开发或者改造。你要是搞过HOG,上手也不难,基本套路都差不多。
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用法也不复杂,cooc3d 了一些demo 数据和测试脚本,基本上照着跑一遍就能懂。如果你熟 MATLAB,应该几分钟就能上
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