Pix4Dmapper中文版3D建模工具

这是一个用于可视化来自mhd文件或ImageType格式工作区的医学图像的3D和4D查看器。其特性包括3D/4D图像可视化、图像叠加、斜切以及3D切片的可视化，还支持基本的刚性注册。推荐与医学图像处理工具箱（如下确认）一起使用。例如： >> im1 = read_mhd('BMode_ultrasound_4D.mhd'); >> im2 = read_mhd('ColorDoppler_ultrasound_4D.mhd'); >> SimpleViewer_GUI然后选择文件->从工作区打开。最新版本可在以下位置找到： https://gitlab.com/compounding/matl

利用图像导数分割密集3D组织中的细胞核。输入为一系列时间成像的z切片，格式为tiff或lsm。基于图像导数进行初级分割后，计算3D属性，并推断分割对象的图像统计数据。聚类方法解析融合的原子核为单个原子核（计算时间较长）。详情见已发表研究文章《3D胚胎成像中的对象分割和地面真相》。

MCmatlab 的蒙特卡罗模拟，专门搞 3D 体素空间里的光传播建模，适合用在组织光学这类混浊介质里。如果你做的是光学成像、热效应模拟或者光热研究，这工具就挺对口。模拟光传播，顺带还能加荧光和热扩散，功能还蛮丰富的。函数结构是典型的MATLAB风格，支持用函数句柄传自定义逻辑进去。用过 MATLAB 写过函数句柄的你，应该会快上手。不熟也别怕，官方文档写得还不错。适配复杂的模拟场景，比如：激光打进组织、看温度怎么升、光怎么走……用嵌套函数管理模拟过程也灵活，代码拆得清清楚楚。就是记得，主脚本里所有函数都得写在.m文件的末尾，这点别忽略。如果你想参考其他相关实现，像生物组织光子迁移模拟或者同轴

COLORVFIELD3彩色3D矢量场绘图仪用于在3D空间中绘制彩色矢量场。函数COLORVFIELD3(X, Y, Z, U, V, W)会在指定的点(x, y, z)处绘制具有分量(u, v, w)的矢量，并根据矢量的长度进行着色。使用jet颜色图，最小的矢量显示为蓝色，最大的矢量显示为红色，共分为32个颜色级别。 用户还可以自定义颜色级别，通过传入NUMBER_COLOR_LEVELS参数调整颜色的细分。例如： X = linspace(-10, 32); Y = linspace(0, 32); Z = linspace(0, 32); U = linspace(-1, -5, 32)

该函数通过在二进制掩码的每个面上绘制方形补丁对象，创建了一种新型的3D堆叠块图。它类似于等值面，但可以清晰可视化整个3D二进制掩码的结构，特别适用于从MRI/CT扫描中勾勒出的复杂结构。函数输入包括：mask - 3D逻辑数组或3D二进制掩码，offset - 可选的补丁坐标偏移量，默认为[0 0 0]，varargin - 可传递给patch命令的绘图样式属性，如颜色或透明度等。

三维曲线图 plot3 基本的三维图形指令: plot3(X,Y,Z)- X,Y,Z 是长度相同的向量，绘制一条分别以向量 X,Y,Z 为 x,y,z 轴坐标值的空间曲线。 plot3(X,Y,Z): X,Y,Z 均是 mxn 的矩阵，绘制 m 条曲线，第 i 条曲线分别以 X,Y,Z 矩阵的第 i 列分量为 x,y,z 轴坐标值的空间曲线。 plot3(x,y,z,s): 带开关量 plot3(x1,y1,z1,'s1', x2,y2,z2,'s2', …) 使用 plot3 可以方便地创建三维空间中的曲线，为数据可视化提供强有力的支持。

这对于处理时需要将3D图像转换为2D图像进行配准的情况非常有用，例如基于地标的薄板样条方法。

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