vegan 包的入门资料真的挺值得一看,尤其你要搞社区生态的话。2015 年那场在巴尔的摩的 ESA 讲习班,资料全都整理在 GitHub 上,内容比较实在,讲得也清楚。
R 语言搞生态其实早就成主流了,vegan算是里面比较好用的包之一,功能多但不复杂。像常见的NMDS
、PERMANOVA
这些都能搞,而且配套的图形函数也挺顺手的,画图也不麻烦。
如果你平时已经会点R
,比如怎么导入数据、怎么索引数据,那这套资料用起来就比较顺。它不是从头教你 R,而是直接上实战,挺适合已经入门的人。
里面的内容主要聚焦在怎么用vegan
做协调,还有一些组间差异的检验,像adonis()
这些函数都有涉及。代码都挺清晰的,运行起来也没坑。
哦对了,如果你还没用过vegan
,可以先看看这个:R package “vegan”及文献数据的重现准备,搭配一起看效果更好。
,这份讲习班资料还蛮良心的,5 小时的内容浓缩得比较紧凑,适合想短时间入门的你。如果你最近有社区数据的需求,不妨拿来练练手。