Gen3D 用于构建3D基因组和染色体结构模型的工具 - 开源

找到相邻体素的功能其实蛮常见的，但要实现一个通用且方式就不那么容易了。这个 Matlab 函数，能你在 3D 体积中，快速找到某个体素的 26 个相邻体素索引，边界附近的会少一些。如果你从事图像、计算机视觉或者类似的工作，这个函数简直就是省时利器。要注意的是，函数利用了sub2ind，你可以轻松获取 i、j、k 位置的体素索引，方便哦。 如果你有类似的需求，可以直接拿来用，也省得自己写那一大堆代码。说实话，这种功能在 Matlab 里好像并没有直接的内置函数，所以它蛮值得推荐的，节省了不少时间。

该函数通过在二进制掩码的每个面上绘制方形补丁对象，创建了一种新型的3D堆叠块图。它类似于等值面，但可以清晰可视化整个3D二进制掩码的结构，特别适用于从MRI/CT扫描中勾勒出的复杂结构。函数输入包括：mask - 3D逻辑数组或3D二进制掩码，offset - 可选的补丁坐标偏移量，默认为[0 0 0]，varargin - 可传递给patch命令的绘图样式属性，如颜色或透明度等。

该程序是基于Vienna开发，完整实现了3GPP TR36.873协议中的3D信道模型matlab代码。

利用图像导数分割密集3D组织中的细胞核。输入为一系列时间成像的z切片，格式为tiff或lsm。基于图像导数进行初级分割后，计算3D属性，并推断分割对象的图像统计数据。聚类方法解析融合的原子核为单个原子核（计算时间较长）。详情见已发表研究文章《3D胚胎成像中的对象分割和地面真相》。

该算法用于重建N路FRET显微镜数据，生成高分辨率的三维总荧光团浓度和蛋白质-蛋白质相互作用的3D图像。

MCmatlab 的蒙特卡罗模拟，专门搞 3D 体素空间里的光传播建模，适合用在组织光学这类混浊介质里。如果你做的是光学成像、热效应模拟或者光热研究，这工具就挺对口。模拟光传播，顺带还能加荧光和热扩散，功能还蛮丰富的。函数结构是典型的MATLAB风格，支持用函数句柄传自定义逻辑进去。用过 MATLAB 写过函数句柄的你，应该会快上手。不熟也别怕，官方文档写得还不错。适配复杂的模拟场景，比如：激光打进组织、看温度怎么升、光怎么走……用嵌套函数管理模拟过程也灵活，代码拆得清清楚楚。就是记得，主脚本里所有函数都得写在.m文件的末尾，这点别忽略。如果你想参考其他相关实现，像生物组织光子迁移模拟或者同轴

高效便捷的3D模型资源库提供了广泛的选择，满足各种设计需求。用户可以轻松浏览和下载所需模型，节省时间和精力。

Matlab代码sqrt如何利用球形嵌入进行3D重建下载Aspire 0.14。从下载Aspire 0.14 Matlab代码，假设已将Aspire软件包提取到名为$ ASPIRE的文件夹中。假设3DReconstruction_SE中的文件已复制到名为$ SE的文件夹中。启动Matlab并执行以下操作：安装转到目录$ ASPIRE运行'initpath'，然后运行“安装”以安装ASPIRE（只需运行一次）。初始化转到目录$ ASPIRE运行“ initpath”（每次启动Matlab会话时都需要运行）。转到目录$ SE运行“ initSEPath”（每次启动Matlab会话时都需要运行）。用

COLORVFIELD3彩色3D矢量场绘图仪用于在3D空间中绘制彩色矢量场。函数COLORVFIELD3(X, Y, Z, U, V, W)会在指定的点(x, y, z)处绘制具有分量(u, v, w)的矢量，并根据矢量的长度进行着色。使用jet颜色图，最小的矢量显示为蓝色，最大的矢量显示为红色，共分为32个颜色级别。 用户还可以自定义颜色级别，通过传入NUMBER_COLOR_LEVELS参数调整颜色的细分。例如： X = linspace(-10, 32); Y = linspace(0, 32); Z = linspace(0, 32); U = linspace(-1, -5, 32)