蛋白表达

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fastAlign: 蛋白质-蛋白质相互作用网络快速全局比对算法
fastAlign算法代码解析 本仓库包含fastAlign算法的MATLAB源代码,该算法用于蛋白质-蛋白质相互作用网络的快速全局比对。 代码结构 examples/: 包含mat3_greedy算法的运行示例,可通过运行example.m文件进行测试。 data/: 存放示例所需的数据文件。 code/: 存放算法实现的脚件,包括: MAT3_rank.m: 根据输入网络的邻接矩阵、alpha值、迭代次数和首选项矩阵计算相似性矩阵。 greedy_match.m: 根据输入网络对的相似性矩阵计算匹配矩阵M。 align.m: 根据输入的两个邻接矩阵和匹配度计算两个网络的对齐图。 bi
PIA蛋白质推断算法
蛋白质组学的推断,PIA 还挺拿手的。它不是搜索引擎,但能把主流的MS/MS结果整合,再来一套统计和可视化,省了不少折腾。你丢进一堆PSM结果,它就能推断出哪些蛋白质靠谱,还能看清肽段和蛋白质之间是怎么对上的,关系图也清楚。整合多个搜索引擎的结果,PIA 得比较自然。不用你手动对着比,FDR也算得蛮靠谱,基本能搞定“同一组 PSM 到底支持几个蛋白质”的问题。尤其蛋白质歧义性的时候,代表蛋白选得还行,没那么主观。支持查看PSM-肽段-蛋白质的完整路径,这个功能我觉得挺实用。尤其是你搞多引擎组合的时候,像Mascot、XTandem、MSGF+之类的,直接一锅炖,比自己拉数据轻松多了。要注意的是
蛋白结构数据库的详细介绍
这份PPT详细介绍了蛋白结构数据库的内容和重要性。涵盖了不同类型的数据库及其在科学研究中的应用,是理解蛋白质结构与功能关系的重要工具。
稀疏表达的编程
稀疏表达的程序代码,使用Matlab验证实现,可供下载使用!
Matlab 符号表达式与数值表达式转换指南
符号表达式转数值表达式利用 sym 函数将数值表达式转换为符号表达式。 数值表达式转符号表达式使用 numeric 或 eval 函数将符号表达式转换为数值表达式。
SQL语言的优雅表达
SQL语言的艺术在于提升DBA编写SQL代码的技能,从而优化数据库性能。
稀疏表达的编程实现
利用Matlab验证实现稀疏表达的编程代码,可供下载使用!
PL/SQL算术表达式
使用算术运算符对数值进行计算。例如:选择列1*12,列2+列3,……从表格(注:列1、列2及列3必须是数字类型)。
Oracle数字转换为中文表达
我们致力于利用Oracle技术更好地开发财务模块,包括数字转换为中文的功能。
正则表达式指南
本指南全面介绍正则表达式,涵盖基础概念、语法和应用。