pbmc3k_filtered_gene_bc_matrices 数据是 Seurat 单细胞基础分析的基础数据集。
单细胞数据资源:pbmc3k
相关推荐
Matlab编程单细胞视动脉可视化
Matlab编程:单细胞视动脉。这是一个皮质简单细胞模型的一维独立实现。
Matlab
14
2024-09-26
awesome-single-cell Matlab单细胞分析集成框架
Matlab 集成的 C 代码资源里,awesome-single-cell算是蛮值得一看的一个。适合做单细胞数据的朋友,不管你是搞RNA-seq还是ATAC-seq,都能找到对口的工具。涵盖了从降维、聚类到差异表达一整套流程,代码写得还挺清楚,直接用 Matlab 跑,效率也不错。
集成了不少语言的优秀方法,像 Python 写的双峰识别、R 写的贝叶斯模型、还有优化过的聚类算法,用起来还蛮顺的。不少包都对单细胞 RNA-seq的特性做了,比如考虑技术噪声、低表达干扰这些,细节挺贴心的。
推荐你看看BASiCS和BEARscc,一个帮你拆分技术和生物噪声,一个专门建模低表达的误差,做高质量离
Matlab
0
2025-07-05
HumanPrimaryCellAtlas-hpca.se-human.RData 单细胞单 r 注释参考图谱
单细胞单 r 注释参考图谱,可本地使用单 r。
数据挖掘
16
2024-04-30
酵母Rhodotorula glutinis单细胞油产量的搅拌与曝气影响研究
本研究评估了酵母Rhodotorula glutinis在不同曝气条件下从甘油生产微生物脂质的效果。实验在摇瓶中进行,涉及搅拌(150至250rpm)和通气(烧瓶体积与培养基体积比为2.5至5.0)两种条件。通过22全因子设计,分析了这些条件对脂质和细胞浓度、生物量产量、脂质产量及脂质体积生产率的影响。统计结果显示,通气水平和搅拌速度显著影响了底物消耗、脂质积累、细胞生长和脂质生产率。最佳条件下(搅拌250 rpm,最高通气量5.0烧瓶体积比),获得了最高的脂质产量(4.5 g/L)和脂质体积生产率(QP = 0.95 g/L·天)。脂肪酸分析显示,油酸占主导地位(53.5%),其次是亚油酸(
统计分析
9
2024-07-15
MATLAB AMI代码基于深度双随机图正则化矩阵分解的单细胞RNA测序细胞类型检测
这篇论文提供了一种基于深度双随机图正则化矩阵分解的方法,用于单细胞RNA测序中的细胞类型检测。编码使用MATLAB实现,主要包括 run_DSINMF.m、factorization_AB.m、factorization_BF.m、constructW.m、NormalizeUV.m、bestMap.m、compute_NMI.m、AMI.m 和 ARI.m 等文件。用户需下载DSINMF文件夹,并参照README.doc进行操作。
Matlab
15
2024-08-08
探索神经元动力学:从单细胞模型到群体节律
神经元动力学建模之旅
这本教材专为高等本科生和研究生设计,引导他们进入数学和计算神经科学的迷人世界。无需高深的生物学背景,只需微积分和高中物理知识,你就能开启这段探索之旅。
旅程亮点:
单个神经元及其动力学模型: 深入理解神经元的内部工作机制,并学习如何用数学模型描述其行为。
神经元网络: 探索神经元之间通过突触和间隙连接的相互作用,以及由此产生的复杂网络动力学。
群体节律: 解开神经元群体中节律活动的起源和功能,揭示大脑协调运作的奥秘。
突触可塑性: 탐구突触连接强度如何随时间改变,以及这对学习和记忆的影响。
实用工具:
教材配套提供丰富的Matlab程序和Python代码,帮助你将理论
Matlab
19
2024-04-30
K3K数据3结构数据字段结构说明字段文文档档
K3 的数据表字段文档,真的是搞 K3 维护绕不开的好帮手。字段解释得挺清楚,不用再自己一个个去查系统字段的意思,省事多了。你如果经常写 SQL、改数据结构,参考这个就顺手。
金蝶 K3 的表字段文档,适合做数据接口、报表开发的同学看看。尤其是在和第三方系统打通的时候,对字段含义搞不清楚,真的容易出错。
像t_Item、t_ICItem这些常见表,字段都配了注释,代码看得更顺眼。连FName、FModel这样的老字段,也都标清楚是干嘛的。
你要是经常用SQL Server查字段或者写视图,顺手收藏下这个资源吧。顺带推荐几个相关的链接,也都还不错:
金蝶 K3 数据库表结构注释
K3
SQLServer
0
2025-07-01
K3TABLES_金碟K3数据表与视图介绍
金碟K3表及视图,涵盖了K3数据表的详细介绍和说明。将帮助您理解金碟K3系统中数据表的结构和使用方法,提供实用的参考资料以便快速上手。每个数据表及其视图都有详细的字段描述和使用场景,帮助开发者和管理员更高效地进行数据库管理与操作。
SQLServer
12
2024-11-06
数据资源3
数据挖掘实验一中使用的第三个数据资源。
数据挖掘
21
2024-05-21