MATLAB AMI代码基于深度双随机图正则化矩阵分解的单细胞RNA测序细胞类型检测

Matlab编程：单细胞视动脉。这是一个皮质简单细胞模型的一维独立实现。

Matlab Hill代码RBCNet采用双重深度学习架构，改善生物医学应用程序中的细胞检测任务，提升手动分割和注释的准确性和可重复性。该算法包括U-Net和Faster R-CNN两阶段，分别用于单元群集分割和小型单元对象检测。RBCNet通过单元聚类技术实现区域检测，提高了在稀薄涂片显微镜图像中的精确度和扩展性。

尽管物体检测已在多个行业产生影响，但在使用巴氏涂片显微镜检测癌细胞方面仍存在挑战。本项目引入了一种机器学习算法，能够在检测和裁剪感兴趣区域（ROI）之前自动检测异常细胞特征。使用宫颈细胞的数字图像，我们通过以下三个关键步骤实现ROI的自动识别：（I）应用于RGB显微照片的非线性过滤器；（II）基于图的聚类（Felsenszwalb算法）；（III）Isodata二进制分类定义超像素。该过程的平均精度达到92%，平均召回率为95%。这一算法是未来智能显微镜电动载物台的核心驱动力，能够扫描完整的载玻片。详见Efficient_Graph_Poster_19.pdf。

该工具库包含多个部分，用于描述论文中的分析过程，涵盖组蛋白修饰信息的分析。用户可以从GitHub下载文件，将目录更改为CRK，然后进行进一步的分析。同时，从GEO网站下载GSE105012_RAW.tar文件，并保存到GSE105012文件夹中。

随着技术进步，我们提出了一种基于低维流形模型的图拉普拉斯正则化Matlab代码，用于3D点云降噪。由曾增、张Gene、吴敏、庞佳豪和成阳在IEEE Transactions上发表。代码包括主要功能如添加噪声的主程序main_addnoise.m、GLR去噪的主程序main_glr.m、GLR去噪函数pcdGLR.m、GLR工具集、用于计算均方误差的度量标准、参数设置函数setParameter、样本点云模型“anchor”以及真实数据和不同噪声水平下的处理结果。

本代码库提供 Matlab 代码，用于论文中基于空间正则化超测度的超光谱图像聚类。SalinasA 和 PaviaU 两个真实 HSI 数据集来自。此外，还可以从代码库访问合成 HSI，即 FourSpheres 和 ThreeCube。

pbmc3k_filtered_gene_bc_matrices 数据是 Seurat 单细胞基础分析的基础数据集。

利用Matlab开发的算法可以有效识别和定位癌细胞，为医学研究提供了重要工具。

此存储库包含用于Matlab的灰度处理和细胞跟踪的源代码。该程序支持荧光或暗场电影的处理，以及相衬电影的跟踪。兼容Matlab 2018a及更早版本，支持'.tif'堆栈和'.nd2'文件格式。还提供适用于Linux的版本。