R语言数据可视化与统计建模

研究生期间的 R 语言作业项目，其实还挺有意思的。项目文件名叫r_nuan，就是“R 语言的温度”那种感觉，听着就不冷冰冰，蛮有温度的。这个项目基本上涵盖了 R 语言常用的那一套：数据导入、清洗、建模、作图啥的都有。 数据部分用的比较多的像read.csv、is.na这些基础函数，搭配as.numeric或as.Date做类型转换，写起来比较顺手。清洗部分做得挺细的，像缺失值、异常值都有考虑，不是那种一股脑就建模的流程。 统计也挺全，线性回归用lm，广义线性模型用glm，聚类也玩了点kmeans和hclust。如果你之前用过caret做模型调参，会觉得这里的流程还蛮清晰的。 作图方面，基础绘图

拥抱数据之美：R语言 R语言，GNU体系下的开源项目，为统计分析与图形呈现而生。它宛如一把精雕细琢的瑞士军刀，助力您探索数据背后的奥秘，绘制精美的可视化图表。

统计里的 R，真的是个好用到爆的小工具，尤其配上《统计建模与 R 软件》这本书，用起来简直事半功倍。书的结构比较贴近熟悉的数理统计课程，基础打得挺牢，还挺系统地讲了建模怎么搞，怎么用 R 来跑数据、画图、做检验。每一章都不是干讲概念，而是直接结合 R 来演示，比如用lm()做线性回归，或是用ggplot2画出各种炫酷图表，代码量不大，上手也不难。R 的包多得让人眼花，但书里挑的都是比较实用的，比如car、MASS、forecast，讲得也比较接地气，有种“老司机带你飞”的感觉。你要是之前用 Excel 数据，换成 R 之后会发现灵活多了，图也清晰，逻辑也顺。更妙的是它还结合了不少实际应用场景，

本课件讲述了基于图标的可视化技术，包括图标特征的数据可视化方法，如Chernoff Faces脸谱图和Stick Figures棍棒图等。其中涵盖了形状编码、颜色图标和瓦片条形图等常用技术，用于更有效地表示和检索文档中的特征向量。

Omic 数据的可视化工具里，OmicNavigatorWebApp算是我最近发现的一个宝藏项目。它是个用R 语言构建的 Web 应用框架，支持把生信结果打包成一个可以直接部署的仪表盘，界面友好，交互也挺顺的。 R 包里的仪表盘功能挺全，完数据，几行 R 代码就能生成网页。不用折腾太多前端代码，直接就能把差异表达、富集这些结果展示出来，还能加图、改样式。部署起来也简单，本地、服务器都行，灵活得。 像RNAseq、多组学整合这些项目，用它来统一展示结果方便。你只需要在 R 里准备好数据，通过OmicNavigator生成对应的项目包，打开网页就能交互式浏览，适合和团队或老板汇报用。 说到底，它的

R语言进阶工具箱： 图形艺术 (Graphics)：绘制基础图形的利器，让数据跃然纸上。 格栅布局 (lattice)：创建多面板图形，揭示数据间细微关联。 空间数据掌控 (maptools)：读取和处理空间数据，绘制空间分布图。 生态学利器 (mefa)：多元生态学和生物地理学数据分析，挖掘生态奥秘。 广义加性模型 (mgcv)：探索非线性关系，构建更精准的模型。 多变量分解 (mvpart)：拆解复杂关系，理解变量影响。 混合效应模型 (nlme)：处理嵌套数据，洞察数据背后的层次结构。 系统发育比较 (ouch)：揭示物种进化关系，探索生命演化之谜。 生态数据分析 (pgirmess)

ggplot2 是 R 语言中基于数据框的绘图系统，以其优雅且强大的绘图功能而闻名。它能够帮助用户轻松创建各种高质量的统计图形，并提供了丰富的自定义选项，满足不同领域的数据可视化需求。

通过结合R语言和Highcharts，实现了动态数据可视化图表的清晰展示。

R数据可视化实战指南 这本实战指南深入解析R语言的绘图系统，助您轻松掌握数据可视化的技巧。书中汇集了150多个实用技巧，涵盖了从基础图形绘制到高级定制的方方面面，并结合ggplot2等R包，为您呈现清晰易懂的代码示例和解决方案。 主要特色： 问题导向，快速定位： 根据实际绘图需求编排内容，方便读者快速找到所需信息。 ggplot2应用与拓展： 以强大的ggplot2包为主线，讲解如何创建各种类型的图表，并拓展其他绘图函数和工具，满足多样化需求。 实用技巧，深入浅出： 每个技巧都针对特定问题提供解决方案，并辅以深入讨论和扩展，帮助读者融会贯通。 目标读者： 具备R语言基础，希望进一步学