DNA序列分析

比较了水生微生物生态学中两种广泛使用的DNA提取方法：苯酚-氯仿法和PowerSoil DNA分离试剂盒。研究评估这两种方法在社区生态学分析中的适用性和效果。尽管OTU数量较少，但这些方法对社区结构的影响显著，且它们的结果差异显著，不可相提并论。文章提供了用于统计分析的脚本，并包含了相关数据集的SRA登录号在NCBI数据库中。

如果您使用我们的代码，请务必引用我们的论文《一种新的基于傅立叶功率谱的DNA序列聚类方法》！论文链接：http://dx.doi.org/10.1016/j.jtbi.2015.026

DNA 序列分割的研究，数据挖掘技术用得挺溜的，尤其是那种能从海量序列中扒出规律的算法，真不赖。PDF 文档讲得比较系统，从基本原理到常用方法，像PrefixSpan、傅立叶功率谱这些技术也都有提到。你要是碰巧做生信相关的前端可视化，顺手看看这类算法结构，说不定会有灵感。Matlab那块也有代码示例，虽然不是前端代码，但懂点逻辑也有。 序列数据里的模式不好抓，尤其像 DNA 这种长又杂的字符串。文档里提到的序列模式挖掘和时间序列平滑方法，其实蛮多能借来在前端搞些动画数据预测啊、用户轨迹还原啥的。尤其你要做可视化组件，可以考虑把结果在D3.js或ECharts里展示，数据结构也好。 推荐你顺带看

时间序列分析预测法分为三类： 平滑预测法：采用移动平均和指数平滑方法，平滑原始数据趋势线。 趋势外推预测法：利用历史数据拟合趋势函数，预测未来趋势。 平稳时间序列预测法：估计模型参数，根据历史数据预测未来值。

如果你对股票数据感兴趣，这份压缩包真的值得一看。它从基础的时间序列到高阶的机器学习预测，覆盖面相当广。比如，你能学到如何用ARIMA模型抓住趋势，也能探索用LSTM复杂的非线性数据。压缩包里还提到了如何清洗和预数据，什么缺失值、标准化这种常见问题都有讲到。最关键的是，还了不少实操代码和案例。无论你是想预测股票走势，还是优化投资策略，这份资料都挺适合你。

利用全国卷烟销量数据，采用R语言进行时间序列分析。分别构建ARIMA季节时间序列模型、Holtwinters指数平滑模型，并评估模型准确性。提供完整R代码和数据集。

本资源包包含教学PPT和MATLAB实现代码，详细介绍了时间序列的基本理论。时间序列是按时间顺序排列的统计指标数列，主要用于基于历史数据预测未来走势。经济数据通常以时间序列形式呈现，时间单位可以是年、季度、月等。

时间序列数据分析的Matlab实现代码。

这个软件包是Phylip 3.6中dnapars.exe的修改版本，原先的版本使用菜单设置参数，我改为了命令行驱动的mbetoolbox_dnapars.exe，并为其构建了MATLAB接口。在MATLAB中，只需设置路径后，您可以轻松地运行mbetoolbox_dnapars。输入文件应为Phylip格式的对齐DNA序列，命名为“infile”。更多关于Phyip包的信息，请参考：http://evolution.genetics.washington.edu/phylip.html。

BWA是一款用于将DNA序列与参考基因组比对的重要软件工具。这种序列比对技术帮助生物学家确定DNA片段的基因组来源，是RNA-seq、ChIP-seq和DNase-seq等许多生物信息学数据分析的关键步骤。