癌症检测

大数据的癌症预测算法项目，数据+代码一应俱全，用起来还挺顺手的。用 Python 写的，支持在 PyCharm 里直接跑，适合你边看边改。里面的数据集也比较丰富，从电子病历到生活习惯，特征够多，训练模型挺方便。 Python 的Pandas和NumPy在前期做数据清洗的时候还挺给力的，什么缺失值、重复值、异常值都能一把抓。做特征工程，比如筛变量、转数据类型，用sklearn这些库就可以搞定。 模型这块呢，逻辑回归、随机森林、SVM 啥的都能用。想玩深一点的，也可以接个神经网络。跑完之后，评估一下模型的准确率和召回率，用 sklearn 里头的classification_report就够用。

基因数据的分类任务，还真挺适合用决策树的。ID3和C4.5两种算法对比着用，更能看出它们的特点。数据集选的是五种癌症的基因表达数据，像是乳腺癌、肺腺癌那类，还挺有代表性的，适合做模型实验。 决策树的优点就是直观，逻辑清晰，尤其是像ID3那种用信息增益来选特征，基本上每一步都能解释得通。你要是数据是纯分类的，属性也不多，ID3其实够用了，响应也快。 C4.5比 ID3 更“精致”，对连续值和缺失值的也更智能些，适合做真实场景下的模型。用信息增益比来避免过拟合这个思路，还蛮实用的。尤其当你面对的是基因数据这种典型的高维小样本数据，C4.5 更有优势。 实验里，数据环节做得也比较全，从缺失值、归一化

六周的 R 语言入门课，莫菲特癌症中心的讲师讲得还挺清楚，节奏也不拖沓，比较适合刚接触 R 和 RStudio 的朋友。课程全程在线，通过 Zoom 直播，之后还能看录屏回放，挺方便的。讲课内容主要是数据清洗、ggplot 画图、Rmarkdown 写报告这些常用技能，基本覆盖了新手最常用的几块。 课程用的是tidyverse套件来数据，配合ggplot2做可视化，代码不难，逻辑也清楚。像mutate()、filter()这些函数用得比较多，讲师会带你一边讲一边操作，现场写代码，还有注释，跟着学效果还不错。 讲到 Rmarkdown 那部分我觉得蛮实用，尤其是要写项目报告、课题文档的你，一边写

matlab图像特效代码手稿和用户手册中的仿真软件。由佛罗里达州坦帕市莫菲特癌症研究所影像系的杰西卡·雷诺兹（jessica.reynolds，位于moffitt.org）创建。出版：审查中。目录Matlab安装程序以运行仿真系统要求下载模拟Matlab路径要求运行模拟设定参数选择预制或创建原始参数绘图保存工作区检查手稿中的数据加载数据中版权和免责声明致谢Matlab安装程序以运行仿真1.系统要求要设置和运行仿真，您将需要一台运行Matlab 2010a或更高版本的计算机。不需要特殊的工具箱。 2.下载模拟将所有内容的ZIP下载到您选择的文件夹中。下载后，解压缩内容并丢弃.zip文件。 3.

异常检测技术的核心在于发现“不正常”的行为或者数据流。对前端来说，虽然不是直接对接这块，但理解这些概念，比如统计学方法、数据挖掘模型，对构建更安全的系统前端架构也蛮有的。尤其是你做管理后台、监控面板时，多数据可视化就靠这些底层逻辑撑着。

在Matlab命令窗口中粘贴并执行文本，可用于共同学习。

matlab 的圆孔检测功能还蛮实用的，尤其你要做一些自动化检测或者图像识别相关的活，挺省事的。项目用的是MATLAB的图像工具箱，把一整套从预到结果导出的流程都跑通了，响应也快，代码也不复杂，适合你快速上手玩一玩。 图像预那块做得还不错，像灰度化、二值化这些基本操作都集成了，尤其是用滤波降噪那步，效果还挺的，能帮你把图像背景弄得干净点。后面的边缘检测环节也有好几种方法，比如你熟的Canny和Sobel都有支持，灵活选。 霍夫圆变换是检测圆孔的主力，用的是参数空间找峰值的思路，比较靠谱。你还能自己设定直径范围和圆度阈值，过滤一些乱入的假圆，这个自定义挺关键的。不然你图里一堆小干扰，结果就全乱了

基于Matlab的开发：MSKCC GDSC癌症基因组学数据分析工具。从Memorial Sloan Kettering Cancer Center的癌症基因组数据服务器（CGDS）检索数据的功能。

高维数据的异常探测方法由Aggarwal和Yu (SIGMOD’2001)提出。该方法将高维数据集映射到低维子空间，通过评估子空间中数据的稀疏性来识别异常数据。

霍夫变换通过点线对偶原理，将图像空间的曲线转换为参数空间的点，进而将曲线的检测转换为寻找参数空间的峰值问题。适用于检测直线、椭圆、圆弧等几何形状。本PPT详细介绍霍夫变换原理，并附带MATLAB源代码。